儘管報紙還存在，但是編輯部的大換血和對採編人員的考察，不可能像這之前的歷次警告那樣輕鬆過關，也很難在短期內恢復元氣。
新聞自由已被扼殺
《南方週末》的「半吊子自由」歸於覆滅，對於大陸的制度來說是再 正常不過的了，因為它的存在本身就是政權恩賜的，當局想甚麼時候收回 ，完全視它的內心恐懼程度而定。被《南方週末》批評過的各地方政府一 直在向中宣部告狀，中宣部也早就對其深懷不滿。換言之，大陸的體制本 身不可能長期容忍類似《南方週末》這樣的報紙，以前不過是在它的承受 力之內而已。
此次大陸新聞界的「良心」被挖，標誌著最低限度的打擦邊球式的新聞寬容和漸進式新聞改革的結束，更顯示出政權的內在恐懼的深度。
對新聞自由的扼殺令人氣憤，但是中國自由知識界對此事件的整體沉 默卻讓人心冷，特別是那些曾經仰仗著這份報紙表達可能被封殺的聲音的 自由知識人，他們的沉默又一次證明了一個可悲的事實：在中國，即便是 觀念上的自由知識份子，在行為方式上卻完全與自由主義的基本常識無關 ，「自由主義的言說」在他們的生存中不過是牟取名利的工具，而一旦真 正的自由受到侵犯，他們的唯一策略就是沉默。因為他們太清楚了，在現存的體制下，對政權侵犯自由行為的公開譴責，所帶來現實結果一定是既 得利益的喪失。
知識份子不敢表態
在既得利益的要脅下，他們對政治異見分子的被抓被關視而不見，還 情有可原；他們對自己同類的受整肅保持沉默，也還勉強可以原諒；但是 ，當他們眼睜睜地看著自己的言論陣地被無理封殺之時，這樣的沉默無論 如何是得不到辯護的。
知識份子捍衛言論自由的事業並不複雜，在自由受到強權踐踏時，只 要挺身而出公開表明自己的立場！即便在表明立場完全無用的社會中，也 必須公開自己的良心所在。在大陸，譴責踐踏自由的公開表態的無用，不 是因為自由知識界的道義立場不夠堅定，更不是因為他們已經多次抗爭而 毫無結果，而恰恰因為在根本上他們沒有自己的道義立場，也很少有持續 的公開抗爭，所以就談不上在大是大非面前進行抉擇的生存勇氣。 (蘋果日報)
