據中國新聞週刊報導，有關專家指出，「水立方」的鋼結構不符合力學原則，不論是在這一點還是其他方面，「水立方」比「鳥巢」的情況更糟。「『水立方』在結構方案上存在著拆除重建的風險」，
更嚴厲的說法來自中國工程院的《意見》，它認為，與「鳥巢」一樣，「水立方」也採用了ETFE(乙烯四氟乙烯聚合物)薄膜。這種薄膜中國無法生產，其價格高達每平方米2000元左右。 「水立方」總面積為12萬平方米的ETFE氣枕，造價至少要2.5億元，佔總造價的30%。
「鳥巢」和「水立方」選擇ETFE薄膜是因為它的透光性好，可以透過10%∼15%的光線，而室內游泳比賽為防止運動員仰泳時出現眩光，是不允許有室外的頂光的。而且ETFE薄膜的隔音效果非常差，進入游泳中心的噪音最高可達80分貝，這是允許噪音量的近3倍。
《意見》提出最好將屋蓋上6萬多平方米的氣枕取消，代之以更為實用的材料，「如果方案現在不調整，等到使用過程中發現屋面的ETFE氣枕不實用而必須改為其他屋面材料，則目前所有其他材料都比ETFE塑料薄膜重，到時就必須將整個結構拆除重建。」
材料表面容易發霉
另據新京報19日報導，國家游泳中心「水立方」將要使用的新型的有機化合物材料不僅造價昂貴，還可能在日後的維護中存在不少難題。一位建築材料方面的專家認為，使用這種材料將使「水立方」面臨薄膜長霉、起皺等難題。
問題的發現者是珠海晶藝玻璃工程有限公司技術總監羅憶。據他介紹，自從「水立方」設計方案確定使用名為「ETFE(四氟乙烯聚合物)」的新材料後，為了準備競標該工程的外部裝飾工程，他開始關注這種材料的特性，並查閱了大量國外資料。
今年2月，羅憶特地訪問了位於英國倫敦郊區的「伊甸園」植物園，而「水立方」的外部材料與「伊甸園」基本一樣。在訪問中，羅先生發現，由於材料的問題，剛剛運營三年的「伊甸園」已出現一些維護難題。
「這些地方已經長霉了，特別難看。」羅憶和程懋指著當時拍攝的照片說。從照片來看，「伊甸園」外面的ETFT材料薄膜與鋼結構的連接處長有厚厚的霉 菌，黑乎乎一片。程懋稱，薄膜長霉，是因為ETFE是一種有機化合物，在一定條件下會受到黴菌侵蝕，而且由於薄膜是具有彈性的，日後清洗起來非常困難。
薄膜上可能還會長「皺紋」
程懋介紹，這種材料的另一個問題是無法消除的「皺紋」。由於薄膜的面積較大，從建築實踐上來說，兩個方向不可能繃得一樣緊，受力不均必然會產生皺紋。
從他出示的照片中，記者看到，「伊甸園」薄膜上面確實有許多礙眼的白色褶皺。程懋說，在北京少雨多塵土的環境下，褶皺處特別容易積累灰塵，一段時間後將非常難看。
同時，由於ETFE薄膜的邊緣在鋼材料構件上，在陽光直射時溫度很高，而中間溫度則較低，時間一長，薄膜就會鬆弛變形。
針對這些問題，「水立方」中方設計單位中建國際(深圳)公司的一位高層昨天說，ETFE材料確實可能存在這些問題，而且問題還不止這些。
除「鳥巢」和「水立方」外，另一標誌性建築－－五棵松籃球館的原方案已經得到修改。不僅如此，目前北京奧組委正在對整個場館項目進行重新評估。可以想見，一場更大的奧運場館「瘦身運動」正在展開
