上午9時正，總統由總統府代秘書長馬永成陪同蒞臨會場。呂副總統秀蓮女士、中央與地方政府首長都起立向總統致敬。典禮開始，總統首先率領大家唱國歌，接著向國旗暨國父遺像行三鞠躬禮；隨後全體與會人士先向總統行禮拜年後，再相互行鞠躬禮。團拜後，總統隨即以「民主臺灣 生生不息」為題發表元旦祝詞。總統致詞之後，全體參加典禮人員並欣賞三首由台大合唱團演唱、高雄市立交響樂團協奏的臺灣之歌的影片，分別是「臺灣」、「戀戀北回線」及「臺灣，我的故鄉，祝福之島」。
總統在祝詞中強調，不論未來兩岸關係如何發展，都必須符合「主權、民主、和平、對等」的四大原則，這是他一貫的堅持，也是多數臺灣人民的堅持。我們必須清楚 的告訴全世界，臺灣的前途只有兩千三百萬人民的自由意志才能做最後的決定，不是中國人大片面通過、訴諸非和平手段的「反分裂國家法」，更不是窮兵黷武的軍 事威脅所能專擅剝奪。
總統也指出，政府的角色必須「積極」負起「管理」的責任，才能「有效」降低「開放」的風險。執政者必須著眼於國家長遠的發展，為可以預見的風險把關，扮演經濟安全的守門人，不能夠討好或取巧。「積極管理、有效開放」將是未來兩岸經貿政策的新思維與新作為。
總統在祝詞中也強調，凝聚臺灣認同、捍衛國家安全、堅持民主改革、永續經濟發展、維護社會公平，這些是我們在新的一年應該共同實現的願景，也是政府團隊的每一位成員必須堅持到底、戮力以赴的明確目標。
總統元旦祝詞內容全文為：
今天是二ＯＯ六年中華民國開國紀念日，阿扁首先要對過去一年來，各位夥伴以及國人同胞的辛勤努力表達最高的敬意。當然，展望未來必先惕勵過往，對於那些未盡 完善、甚至有所偏失或缺憾的部分，所有的行政團隊，包括阿扁個人在內，也都必須深切反省、徹底檢討、有所精進。衷心期盼新的一年，在國人同胞與政府的攜手 努力之下，能夠為臺灣開展新的氣象，讓每一個人創造新的希望。
最近有一項「尋找臺灣意象、SHOW出臺灣精神」的全民票選活動，其中包括：玉山、櫻花鉤吻鮭、原住民圖騰、客家桐花、臺北101大樓、太魯閣峽谷……等等，每一種都是多元豐富的臺灣象徵，分別獲得許多民眾的認同和青睞。在阿扁的心目中，生活在這一片土地上的兩千三百萬臺灣人民，共同守護家園、攜手戮力打拼的圖像，便是最美麗動人的臺灣意象，具體彰顯著勇敢強健的臺灣精神。
臺 灣人民所締造的成功故事，不管是經濟的繁榮或者民主的成果，都曾經遭逢艱難挫折與嚴峻挑戰，但是我們從來沒有灰心喪志，更不曾因為一時的困頓而怯懦退縮， 最後才能披荊斬棘、勇往直前的走出臺灣的一片天。其中最鮮明的例證，就是今天我們所在的這一棟建築。六十幾年前，這裡曾經是殖民統治的象徵，之後長期作為 戒嚴威權的圖騰，直到十年前總統直接民選之後，才真正蛻變成為主權在民的臺灣民主見證。今天我們在這裡齊聚一堂，有在野黨的國會領袖，也有不分黨派的國之 大老與政府要員。人民經由定期選舉，選擇民意代表、地方首長、以及國家的領導人，也可以透過公民投票決定國家的重大政策，這就是民主的價值與政黨輪替的可 貴。
伴 隨著新舊世紀的交替，人民的力量讓臺灣民主的發展持續大步向前，也讓過去被外來政權視為禁忌的「臺灣主體意識」逐漸在這一片土地上生根，在人民的心中茁 壯。以臺灣為中心的主體意識擺脫了歷史的窠臼與政治的教條，發源於兩千三百萬人民對自我的認同、土地的情感、以及命運與共的體認。不管過去從什麼地方來， 沒有人再把這裡當做異鄉、把自己當做過客，因為我們的代代子孫都將在此安身立命，臺灣就是故鄉，每一個人都是主人。
在 「臺灣主體意識」的發揚以及人民渴望當家做主的民主浪潮之下，國家認同已然成為不分族群、無可迴避的嚴肅課題。如果連我們都無法確認自己的身份、不能夠凝 聚國人對於國家認同的共識，臺灣人民將永遠缺乏應有的自信，也無法團結對外、立足於世界的舞臺。設想我們面對國際的友人，向他們介紹自己的家鄉－那裡有美麗的山川、勤勞友善的兩千三百萬人民、我們信仰自由民主人權的普世價值、平均國民所得超過一萬五千美元、還有世界最高的臺北101大樓。但是，很遺憾的，我們無法清楚的說出自己國家的名字－這是多麼令人感傷而難堪的處境！
如果沒有國家認同，就無法保衛國家安全，也無從捍衛國家利益！這就是為什麼我們必須堅持「臺灣主體意識」，並且誠摯呼籲朝野政黨能夠超越統獨與族群，共同凝聚臺灣人民對於國家認同的基本共識。
臺灣是我們的國家，土地面積三萬六千平方公里。臺灣的國家主權屬於兩千三百萬人民，並不隸屬於中華人民共和國。臺灣的前途只有兩千三百萬臺灣人民才有權決定。
也許仍有部分人士對於這樣的國家主權論述無法完全滿意，但是阿扁始終認為，我們必須「立場堅定、務實前進」。日前某政黨的主席接受國際媒體訪問時，公開表示 「統一」是該政黨的終極目標。相信許多國人同胞對於這樣的主張非常難以認同，但是我們可以諒解、也應該包容。畢竟臺灣是自由民主的社會，政黨或個人的主張 是他們個人的自由，但不能因此而剝奪臺灣人民選擇的自由，否則就違反了「主權在民」的基本原理。
不 論未來兩岸關係如何發展，都必須符合「主權、民主、和平、對等」的四大原則，這是阿扁一貫的堅持，也是多數臺灣人民的堅持。不管是中國國民黨或者中國共產 黨，都不能以任何違反這四大原則的手段，為臺灣前途設定非民主的前提或排除自由的選項。我們必須清楚的告訴全世界，臺灣的前途只有兩千三百萬人民的自由意 志才能做最後的決定，不是中國人大片面通過、訴諸非和平手段的「反分裂國家法」，更不是窮兵黷武的軍事威脅所能專擅剝奪。
目前中國解放軍除了在對岸部署七百八十四枚戰術導彈瞄準臺灣之外，更積極強化海、空軍戰力，配合地面、資電、及特種部隊，對台海和平造成嚴重的衝擊與直接的 威脅。中國一方面運用「法律戰、輿論戰、心理戰」的「三戰」策略，積極藉由「法理爭奪、輿論較量、心理攻勢」等手段，為對臺政治、軍事、外交鬥爭開創有利 的條件，企圖瓦解臺灣人民的抗敵意志，達到不戰而屈人之兵的終極目標。另一方面，解放軍更積極擴增軍備戰力，為對臺作戰進行三階段準備任務，明確訂定期程 目標為：二ＯＯ七年之前，全面形成應急作戰能力；二Ｏ一Ｏ年之前，具備大規模作戰能力；二Ｏ一五年之前，具備決戰決勝能力。中國對臺所謂的「軟硬兩手」策 略，「軟」的是假，「硬」的才是真，繼一九四九年所謂「消滅」中華民國之後，最終要併吞臺灣的企圖從來沒有改變。
包括美國、日本近期公布的「中國軍力報告」都明確指出，中國軍力的發展顯然超出合理的防衛需求，臺灣面對如此立即而明顯的威脅，絕對不能心存任何僥倖幻想。 如何積極強化臺灣自我防衛能力，有效因應台海軍力平衡逐步向中國傾斜，已經是攸關國家安危與台海和平的重大課題。三項軍購預算的延宕、遲遲無法付委審查， 不但嚴重影響國防建軍及強化防衛能力的進程，更引發國際社會對於臺灣自我防衛決心的疑慮，對國家安全將造成難以挽回的傷害。因此，阿扁要再一次懇切呼籲在 野政黨領袖及立院黨團能夠理性深思，盡快讓軍購預算能夠付委討論，該如何刪減、特別預算或年度預算該如何調整，行政部門都可以尊重立法院的高見，但是絕對 不能再藉故拖延下去。國人同胞也應該對攸關切身安危的國防預算付出關心、共同來監督，積極敦促行政與立法部門為國家安全負起應有的責任。
國家安全的核心價值在於「保國安民」，經濟發展的終極目標應該是「繁榮均富」，兩者都是臺灣永續發展的必然要件，任何一項都不能偏廢。過去一年，全球經濟景 氣在原油價格高漲的威脅下，大體呈現溫和成長的局面。二ＯＯ五年臺灣的經濟成長預估為百分之三點八。失業率可望降到百分之四左右，達到五年來最佳的狀況。 此外，平均國民所得自一九九二年突破一萬美元之後，歷經十三年的努力，去年首度超過一萬五千美元的目標，這是國人同胞共同打拼的成果，也代表臺灣經濟發展 跨越了新的里程。
雖然臺灣的經濟持續在穩定中成長，但是無可諱言的，在中國、印度、東歐等新興工業國家經濟勢力快速崛起之後，臺灣經濟的前景儘管樂觀，但也依然充滿挑戰。
在全球化的浪潮中，產業外移、製造鏈分段外包已成為工業化國家的普遍現象，臺灣也不例外。根據政府最新的統計，國內接單海外生產的比率已經高達百分之四十以 上，其中，約有百分之九十集中在中國。部分產業為追求降低成本而外移固然可以理解，但長期仰賴低廉勞力為利基，藉由大量生產、削價競爭的產品，往往會因競 爭者的崛起而迅速成為微利化、甚至是無利可圖的商品。因此，我國部分產業競相前往中國設廠的模式是否得以長期維繫，以及是否符合所謂的「藍海策略」顯然不 無疑問，但卻已對臺灣帶來結構性失業與薪資水平調升不易的沈重壓力。
依據二ＯＯ一年經發會的共識，政府過去幾年在兩岸經貿政策上一直秉持「積極開放、有效管理」的基本原則。無論是開放或管理，其目的都是為了臺灣整體的利益， 而非中國的壓力或個別廠商的私利。外界也不應將複雜的兩岸經貿政策，簡化為「開放」或「緊縮」的籠統二分法，或者心中只有「積極開放」，而忽略了更重要的 「有效管理」。兩岸經貿政策所追求的不是個別或企業本身的經濟利益而已，臺灣能夠永續發展才是我們所追求的最大利益。
具體而言，政府的角色必須「積極」負起「管理」的責任，才能「有效」降低「開放」的風險。執政者必須著眼於國家長遠的發展，為可以預見的風險把關，扮演經濟安全的守門人，不能夠討好或取巧。「積極管理、有效開放」將是未來兩岸經貿政策的新思維與新作為。
因應國際激烈的競爭，唯有落實「深耕臺灣、布局全球」的經濟發展策略，而非僅僅依附一個特定的市場或單一經濟體。我們不能對中國的市場視而不見，但也不能把 中國視為全部的市場或最後的市場。全球化絕對不等於「中國化」。臺灣不可能「鎖國」，但是也不能把經濟的命脈和所有的籌碼都「鎖在中國」。
為了確保永續發展的競爭力，臺灣要走向高附加價值的知識經濟，必須盡速落實各項攸關經濟體質的改革措施，積極協助產業成功轉型升級，同時要循序推動兩岸經貿 關係，有效因應中國的磁吸效應。這些政府都有相應的對策與腹案，但我們也必須持續傾聽產業界、學術界、勞工朋友以及在野黨不同的聲音，做好溝通，凝聚共 識，併進一步檢視未來的國家整體經貿發展策略。這是為什麼政府要響應民間的呼籲，籌開「二次經發會」的原因。另一個重要的目的，則是為了在產業振興和社會 公平之間、在繁榮進步與均富正義之間，尋求新的平衡點。
經濟發展的目標在於追求社會的繁榮，提升人民生活的水平，同時也必須兼顧社會的公平與正義，讓每一位國民都享有均衡發展的機會，並且公平分享社會進步的成果。過去的半個世紀，臺灣創造了舉世稱羨的「經濟奇蹟」，但不可諱言的，也犧牲了一部分對社會公平正義的堅持與追求。
過去為了產業振興，政府提供許多租稅優惠的措施，長期累積下來，已經明顯造成租稅負擔的不公。目前四分之三的所得稅來自於勞動所得，而資本所得僅佔四分之 一，許多廠商在技術及市場都已臻成熟之際，仍然享有高額的租稅減免，不但侵蝕國家的稅基，也引起社會公平的爭議。經過長期的努力與朝野的合作，我們終於完 成「所得基本稅額條例」的立法，正式建立符合租稅公平精神的「最低稅負制」，並且從今天開始實施。未來政府仍將持續為達成擴大稅基、追求賦稅公平與保障弱 勢等目標全力以赴。
隨 著時代的變遷，臺灣跟許多先進國家一樣，逐步進入「高齡化」與「少子化」的社會，對於民眾退休後生活的保障與照顧，將成為未來政府施政的重要課題之一。過 去經由「老農津貼」、「敬老福利津貼」的全面實施，加上去年七月一日正式上路的「勞退新制」，政府正逐步為弱勢的族群及團體建構完整的社會安全網。同時， 由於過去制度設計的不健全，造成部分軍公教人員退休後所得比在職時還高的現象，政府已著手進行退休所得合理化的調整。未來政府將進一步推動各項退撫機制的 整合，以早日促成「國民年金」的開辦，為臺灣的社會安全及國民福祉跨出歷史性的一步。
去年十月十日，阿扁期勉大家，未來在兩年多的任期內，將進一步深化包括：金融改革、稅制改革、18％ 優惠存款利率改革、媒體改革、不當黨產的追討及憲政改造等六大改革。欣慰的是其中幾項重大改革，在短短兩個月的時間，已有具體的進展與成果，並沒有因為選 舉因素而躊躇不前，或因為選舉的結果而畏懼退縮。改革絕對是痛苦的，改革也一定要付出代價，只要相信臺灣、堅持改革，做對的事、走對的路，雖千萬人，吾往 矣！
在六大改革當中，最困難的是不當黨產的追討與憲政改造二項。過去幾年，對不公不義而取得的不當黨產追討不力，讓人民大大失望，這是無可推諉的事實。立法院朝 小野大固然是原因之一，但政府決心不夠，甚至為了朝野和諧或為了預算、法案而做妥協，結果不僅無助於法案、預算的通過，反而讓霸佔不當黨產的政黨有更充裕 的時間可以變賣、賤賣、脫產。政府應該堅持站在公義這一邊，站在人民這一邊，結合社會力共同積極推動對不當黨產的追討工作。
至 於最重要的憲改工程，未來的推動必然是由下而上、由外而內、先民間後政黨，以全民共同的智慧與力量，在二ＯＯ八年為臺灣催生一部合時、合身、合用的新憲 法。原先阿扁以為催生臺灣新憲法只能畢其功於一役，但去年六月七日第一階段憲改的提前展開，並順利完成阿扁二ＯＯ四年五二Ｏ就職演說所揭櫫「首次憲改的程 序，我們仍將依循現行憲法及增修條文的規定，經由國會通過之後，選出第一屆也是最後一屆的任務型國代，同時完成憲政改造、廢除國大、以及公投入憲。」所 以，對接下來第二階段的憲改工程，我們應該更有信心。天底下沒有不可能的志業，也許辛苦，或許艱難，只要相信就有力量，只要堅持就會成功。
阿扁重視並樂見民間憲改運動的發展，更期許民間版「臺灣新憲法」草案在今年二ＯＯ六年能夠誕生。如果臺灣社會條件夠成熟，明年二ＯＯ七年舉辦「新憲公投」，誰說不可能？這是臺灣國家的總目標，也是政黨輪替最重大的意義所在。
各位夥伴，親愛的國人同胞，凝聚臺灣認同、捍衛國家安全、堅持民主改革、永續經濟發展、維護社會公平，這些是我們在新的一年應該共同實現的願景，也是政府團 隊的每一位成員必須堅持到底、戮力以赴的明確目標。除此之外，隨著三合一選舉的結束，地方首長新的任期開始，阿扁要特別期許中央與地方政府能夠通力合作， 將治安的改善與社會秩序的維護當做未來施政的要務。選舉的政黨競爭只是一時的，臺灣的永續發展才是永遠的。讓人民安居樂業，這是不分朝野黨派、不分地方中 央的共同責任。內閣團隊的相關首長必須設定治安改善的期程目標，並且落實績效管理。如果做不到，就要負起完全的責任；做得好，也請國人同胞給予最大的支持 和鼓勵。
此外，未來內閣團隊的每一位成員，不論職位高低，都必須嚴格謹守「清廉執政」的最高標準。因為過去團隊少數人的偏差，辜負了人民對我們的期望，阿扁願意承擔 所有的責難，再一次向全體國人同胞鞠躬道歉。阿扁有決心，更有信心，並要求每一位工作夥伴必須接受最澈底的檢驗，嚴格的自律、自清，重新建立清廉執政的信 譽，找回民眾的信賴與肯定。同時，我們也期盼目前仍擱置在立法院程序委員會的「法務部廉政局組織法」能夠獲得朝野政黨的支持，早日順利審議通過。
親愛的國人同胞，這一段時間，阿扁經常反覆聆聽一首本土創作歌謠，心中充滿難以形容的感動。這首歌的歌名叫「臺灣」，其中的兩段歌詞是這樣寫的：
「臺灣的四邊攏是海，青山綠水隨阮來，美麗山河咱所愛，毋通乎人來破壞。
臺灣是生咱的所在，感念感恩在阮心內，付出情意付出愛，代代花蕊代代栽。」
上 天賜予我們這片豐富獨特的美麗山川，數百年來勇敢的臺灣人民以血淚交織，創造光榮的歷史，寫成動人的故事。臺灣好比堅固的搖籃，也像母親的懷抱，呵護著兩 千三百萬福爾摩沙的子民，在這裡孕育夢想、打造希望。每一個人都應該感恩，更應該付出，共同來守護臺灣這一片土地。不管遭受多大的挫折挑戰，千萬不能灰心 喪志，必須堅定不移、奮勇向前。因為這裡是我們永遠的家園，臺灣是我們萬代子孫的希望和未來。
最後，敬祝新的一年風調雨順、國運昌隆，民主臺灣永續發展、生生不息，全體國人同胞及各位夥伴平安快樂、吉祥如意。謝謝大家。
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元旦文告危機消毒府院36小時內外斡旋
（中國時報）陳水扁總統元旦文告造成風暴，府院總動員展開卅六小時危機處理。府方已再度向美日兩國說明，陳總統的「新憲公投」不涉統獨，兩岸政策也沒有改變； 外交部也訓令各駐外館，必須充分說明。總統府副秘書長黃志芳更是昨天一早就把廿多位駐臺外籍記者請到總統府，進行強力消毒。
據 指出，府方早已意識到陳總統元旦文告出爐，將會掀起波瀾，前天陳總統講完，總統府、國安會立即召開緊急會議，決定分由代秘書長馬永成、副秘書長黃志芳等核 心成員，與外界溝通，在第一時間爭取有利的詮釋。原本有人主張，由負責整合這篇文稿的國安會諮詢委員林錦昌說明，惟近來退居幕後多時的他婉拒，希望由府方 發言系統處理。
後來，討論後決定由馬永成主要負責黨內派系溝通，黃志芳則負責對媒體說明，雙管齊下，分頭進行。避免黨內派系因搞不清楚狀況，胡亂開炮；或媒體負面言論，影響國際社會對總統文告的詮釋。
從 陳總統宣讀文告到昨晚大約卅六小時，府院持續緊盯海內外相關發展，電報、熱線不斷。府方雖在陳總統發布文告前，已將相關內容知會美方，美方並沒有特別的回 應。事後，陳總統仍親自與駐美代表李大維通電話，瞭解與美方的溝通狀況。外交部也隨即訓令所有駐外館處，必須盡力說明。
黃志芳也在與國內媒體溝通後，連繫廿多位駐臺外籍記者到總統府做背景說明。他向外籍記者強調，陳總統的兩岸政策沒有改變，過去是太過重視「開放」而忽略「管理」，現在有必要把重點移回到管理部分，待制度更完善後，才有辦法更為開放。
黃志芳指出，政府有關逐步開放三通、大陸觀光客來臺等兩岸政策並未改變，行政部門會就如何加強管理召開內閣會議予以討論。黃志芳並舉例，聯電「和艦案」就是 非法偷跑案例，台積電曾守法提出八寸晶圓到大陸設廠，但一個偷跑案件，打亂守法的八寸晶圓設廠審查。偷跑的影響到守法的，就是因為管理沒做好，所以先要有 遊戲規則，大家遵守遊戲規則，就能有效開放。
政府一手主導黨政靠邊站扁意志的貫穿
陳水扁總統元旦文告再度引發朝野爭論不休，總統府高層昨日會商後決定，不再逐一個別回應。據指出，這篇文告完全是陳總統意志的貫穿，只有極少數核心幕僚參與，事先並未與行政部門討論。
據指出，文告草擬過程，涉及臺灣主體意識的部分段落，陳總統覺得幕僚沒有寫出他的心境，還親自動手寫了好幾段。其餘不是他親筆寫的，也都是執筆人跟他深談之後所寫，原汁原味反映他的心情，堪稱是扁近來重大談話中，「自製率」最高的一篇。
陸 委會主委吳釗燮因坦承未參與總統元旦文告，昨日在立院遭在野黨抨擊。相關人士透露，這篇文稿完全是由總統府主導，與過去扁重大談話的運作模式不盡相同，之 前沒有跟行政院或黨討論。文稿核心團隊包括，國安會秘書長邱義仁、諮詢委員林錦昌、代秘書長馬永成、諮議劉世忠等人，作業時間約一個月。
文稿團隊原本對內容保密到家，扁日前利用前往台大醫院接受健康檢查時，向媒體預告元旦祝詞「很重要」，更在元旦前三天，透過阿扁電子報稍微預告祝詞內容。這一切步驟，也都是陳總統自己的考量，希望喚起社會大眾對這篇談話的重視。
府方人士表示，陳總統將兩岸經貿由「積極開放、有效管理」，轉為「積極管理、有效開放」，也是陳總統閉關一個月所領悟出來。儘管這段期間見不少獨派人士，但這些政策改變，不盡然是獨派施壓結果。
