據介紹，目前已經探明的古城遺蹟面積已達2.4平方公里，規模不遜於上世紀70年代的澄江縣城，主要建築共有8個，其中兩個高大階梯狀建築和一座圓形建築最為重要。
其中一座高大的階梯狀建築共分三層，底部寬60米，第二層寬32米，頂層寬18米，整個建築高為16米，從聲吶掃瞄圖上可以看出，它的台階非常整齊對稱。
而另一座階梯狀建築氣勢最為恢宏。它上下共五層，第一層底部寬63米，第二層寬48米，第三四層倒塌比較嚴重無法仔細測量，第五層寬27米，整個建築高21米，類似於美洲瑪雅人的金字塔。在每一層大的台階之間都有小台階相連，其中第一級大台階從底部有一條筆直的小台階直通而上。
此外，在這兩座建築中間還有一條長300多米，寬5-7米的石板路面，用不同形狀的石板鋪成，石板上面可以找到各種各樣的幾何圖案。在另外一片區域裡，耿衛還發現了一座圓形建築，底部直徑為37米，南面偏高，依稀可以辨別出台階，該建築北面倒塌得比較嚴重，東北面有個缺口，形狀類似於故羅馬的鬥獸場。
專家認為，高大的台階狀建築很可能是祭臺。他們的主人會是漢代俞元城的居民嗎？在雲南晉寧石寨山曾出土大量古滇國時期的青銅器，很多青銅扣飾(一種青銅質地的圓形小飾品)上都有台階式建築的圖案，有的上面還有用於祭祀的桿欄式建築圖案。這表明祭祀活動在古滇人的生活中已經相當重要，那些高大的台階式建築就是古滇人祭祀活動的遺存。
更令人稱奇的是，刻畫在一些青銅扣飾上的環形台階式建築圖案，幾乎與水下發現的圓形建築形式一模一樣。青銅器上的環形台階式建築分上下兩層，第一層有十餘人，第二層有三四個人，坐在台階上觀看鬥牛或者其他表演。據認為，水下圓形建築就是扣飾圖案描繪的原型。也有專家認為，圓形建築是娛樂設施或是體育場。
目前，關於古滇國的考古成果幾乎全都集中在墓葬和文物的出土上，曾經興盛500餘年的古滇國沒有發現任何生活建築的遺蹟，這讓人難免猜測，湖底高大的建築與青銅器上的圖案相似絕非偶然。
在撫仙湖的眾多傳說中，關於海馬的傳說最為離奇。據說這種海馬可以在湖面上奔跑如飛，經常在晨霧中出現，霧散後潛入水中，在古縣誌中多有記載。
撫仙湖水位很低的時候，在很淺的地方露出的石板上，人們可以看到直徑在8-15厘米的孔洞，形狀酷似馬蹄印。在水下建築上，也發現很多類似的孔洞，有些內部邊緣還有石釘，這些圓孔插上木樁，再用繩子連接起來，會形成一個規則的長方形。
考古學家通過研究古滇文明的青銅器圖案發現，古滇人的建築主要是以桿欄式建築為主，這種桿欄式建築是先用竹木搭成房架，底層懸空，再修牆而形成的建築。據推斷，所謂海馬的腳印就是桿欄式建築用於插立木的基礎，撫仙湖水下古蹟一定與古滇文明有著直接的聯繫。
在雲南澄江縣的歷史上，有史可查的有三個城市，其中最早的是俞元古城，後來在史書上神秘消失，這是很多專家傾向於認定水下城市就是俞元城的原因。另有人認為「俞」在古漢語中有「最、最初」之意，而"元"有"原始、根基"之意，兩者結合起來，就是「最初的高大的根基」。
和其他的古代文明遺蹟相比，撫仙湖水下遺蹟的規模絕不遜色，擁有超過21米的高大建築，這在瑪雅文明遺蹟中都是不多見的。對它的研究將是一個世界性的課題，困擾考古界多年的古滇文明的謎團，很可能透過撫仙湖水下古蹟揭開。
