有關國際環保組織批評說，中國幫助柬埔寨興建的兩座最大的水壩，將對柬埔寨的自然生態環境造成威脅。
總部在美國的國際環保組織"國際江河"在星期一發布的一份報告中指出，由中國投資6億美元興建的這兩座大壩，將對柬埔寨的自然生態環境帶來嚴重破壞，並減緩當地經濟的發展。其中一座大壩完全座落在柬埔寨一個國家公園的範圍內，將淹沒兩千英畝被保護的森林。報告說，兩座大壩在2010年建成後，還將影響噹地居民的生產和生活，影響河流的自然形態，最終影響到柬埔寨經濟的可持續發展。
就此，在美國的環保人士林俊達博士評論說，： "總體來說，現在大壩爭議對生態環境角度來說，水壩對環境肯定會有不良的影響。如果是特別大的壩，那影響就更加厲害。從環境角度當然是不好的，當然，從發電、防洪這個因素就要綜合考慮。但對生態環境是有害的。"
分析建水壩對生態環境會造成哪些不良影響，林博士說： "最主要的一個就是改變了整個水流的規律。原來是不停地流，現在是水流量減少，防水的時候水流量增大了，規律就改變了。很多種類經過了幾千年、幾萬年都是靠水流的規律。水質都已經適應了這個情況。突然間人為地改變以後，很多種類就不能適應。還有就是污染，大壩建起來以後，上游的水就變成了不動水，儲存起來以後污染了，不能及時排下去，也成問題。"
在美國的國際中國環境基金會總裁何平表示，建水壩因為是長久性工程，並且會對環境造成影響，應當謹慎。但如果柬埔寨的能源極度缺乏，也不是完全不可以考慮： "如果是缺煤，或者是缺別的資源，像是風能等，那因為水電相對來說污染還是比較小的。這就需要做一個評估，看看生態破壞能不能夠減緩或者是維持到一定的程度。因為建壩也不是不可以的。"
何平說，與其它發電形式相比，水力發電是節約能源的措施之一，但要更多鼓勵發展小水電： "應該主要發展小水電，因為它對生態破壞比較小，投資成本比較低。所以發展小水電就比較合適。要建大壩的話，從環保的角度、從經濟的分析，還會有移民、文化等問題。所以，水電是再生、是可再利用。但是，高壩對整個生態系統有影響，還有河道堵塞，改道等影響。所以，高壩的建設要極度謹慎。"
法新社的報導援引柬埔寨有關非政府組織人士的話說，柬埔寨能源的極度匱乏是公認的事實，但政府可以採用其它辦法，來解決柬埔寨的能源問題。
