一般而言，大規模天災發生後第10天左右到第30天是爆發疫情的高風險期，因此災區防疫工作刻不容緩。這次重災區範圍超過10萬平方公里，直接受災人數就達1000萬人，震倒了400多萬戶房屋，有20多個縣市缺乏用水，成千上萬的人擠在收容所、或露宿戶外。世衛官員表示，目前主要威脅並不是罹難者屍體腐爛，而是遭到污染的水源以及臨時收容所的擁擠狀況。大批屍體急需處理
四川震災3萬多死難者屍體，已處理了一萬多具，這兩天又陸續挖出數千具屍體，火化設備窮於應付，不少屍體須採取群葬方式掩埋，但因人手有限，許多屍體仍無法及時處理。
世衛官員指出，透過不潔用水傳染的疾病才是衛生官員最擔心的問題，在衛生條件低落的環境中，極易傳染霍亂。而災區從烹煮食物的爐子到廁所都非常缺乏，當務之急是提供足夠的飲水、食物和居處。
千萬牲畜死亡 影響水和食物
中國農業部官指出，罹難者遺體通常埋得較深，1200多萬牲畜的屍體則可能污染水和食物供應，引發疫情的危機更大。
俄國防疫專家奧尼成科則提醒說，地震災後容易出現鼠疫，許多災民暴露在大自然中，增加了受鼠疫威脅的危險。1994年印度發生強烈地震，震區老鼠遷移導致不少人感染鼠疫，俄羅斯甚至因此切斷了和印度的空中交通。
據災區氣象預報顯示，未來兩天，災區大部分天氣晴朗，雖然有利救援工作，對於未及時處理的屍體、生活垃圾等將帶來更多問題。可能爆發處疫情的包括禽流感、腦炎、狂犬病，傷者也可能出現炭俎和破傷風。
雖然迄今已空投數百萬瓶裝水到重災區，但根本不夠，災區極需淨水設備。據報導，第一批八部淨水設備已運到成都，每部可供應一萬人所需用水。
災區急缺殺毒藥劑
中國衛生部派遣3萬4000名醫療和疾病管制人員在重災區工作，農業部向災區調撥1000噸消毒劑、50噸殺蟲滅鼠劑。但以北川縣來說，20個鄉鎮十之八九都還沒有打通救災道路，無法進行防疫消毒。整個北川的防疫需要消毒殺菌劑約100噸，現在只有5噸，另外還需要10噸以上殺蟲劑，現在也只有幾百公斤，缺口非常大。
青川縣 腹瀉病患暴增
【編譯朱小明/綜合報導】
四川大地震重災區青川縣出現腹瀉的災民越來越多，顯示防疫工作迫在眉睫。當地救災指揮部表示，青川災區防疫工作已進入關鍵時刻。
青川災區最近幾天氣溫上升，細菌容易滋生。青川縣木魚鎮、板橋鄉等多個鄉鎮出現腹瀉病人增多的現象，青川救災指揮部已派出430人的專業防疫隊伍，在全縣各個鄉鎮、村開展防疫工作。
