臺灣各界對"無國界記者組織"2009年報告，將臺灣媒體自由度下降22名反應強烈。
"無國界記者組織"公布2009年全球媒體自由度報告，臺灣的排名從前一年的36名，倒退到第59名
在還沒有正式公布排名之前，臺灣政府發言人-臺灣新聞局局長蘇俊賓就表示，他無法接受這個結果。
在野黨-民進黨的立法委員為此舉行記者會說，"無國界記者組織"這次的報告證明國民黨政府試圖操縱媒體。
"干預媒體"
有些分析人士指出，臺灣的公共電視基金會投書該組織，指稱臺灣的中央廣播電臺、中央社等等公營媒體在去年被施壓，被迫改寫新聞。
依照慣例，臺灣公營媒體的領導層隨政黨輪替而更換，因此成了"政治立場相近者主掌公營媒體"。
分析人士說，這也導致"無國界記者組織"認為臺灣的媒體不自由。
也有報導說，去年（2008年）11月，海基會和海協會在臺北舉行江陳會期間發生抗議事件，造成記者受傷，也是造成"無國界記者組織"將臺灣媒體自由度排名降低的理由之一。
對有關政府施壓，迫使公營媒體改寫報導的指稱，駐法國的臺灣官員向BBC中文網表示，除了他們出面和該組織溝通之外，臺灣總統馬英九也曾經致函否認。
不過，從結果看來，似乎"無國界記者組織"並沒有接受，而受訪的臺灣官員也對此表示無奈，只能表示會繼續溝通。
整體情況
該組織的亞洲地區負責人-布羅塞爾則向BBC中文網表示，他們評分主要基於當地記者、記協回答的問卷，而且反映的是整體的媒體情況而不只是政府是否干預媒體。
布羅塞爾也不否認，記者本身的政治立場，也可能會影響評分。
他說，去年有記者採訪臺北江陳會而被抗議者毆打，此外大陸記者在臺採訪受到限制等等，都造成了臺灣排名下滑。
布羅塞爾表示，名列前30的國家和地區，只要稍微有些影響記者權利的事件，很容易就會被排除到50名之外。
他還說，也不是該組織是否不接受馬英九對影響媒體報導、干預媒體人事指稱所做的否認，因為發生了如此的事件，自然就會影響排名。
布羅塞爾對大陸記者採訪受限則表示，當初臺灣為了不能在世衛組織作報導，曾經也抗議過，如今為了"國家安全"的理由設下限制，理由不夠充分。
