埃及人扎瓦赫裡-有可能是基地組織未來領導人
本拉登雖然死亡，但這並不等於基地組織也已滅亡。誰將接替本拉登成為基地組織領導人，目前還不清楚。他的繼任有可能是埃及人扎瓦赫裡，也有可能是祖籍葉門的美國人阿瓦拉基。
本拉登被擊斃後，在埃及首先表態的是阿布德·佐莫爾（Aboud al Zomour）。他是有可能成為本拉登接班人的扎瓦赫裡的親密戰友。 1981年，佐莫爾因刺殺埃及總統薩達特被捕入獄，最近才重新獲釋。他呼籲世界各地的本拉登的同情者不要採取報復行動。他說， "襲擊遊客和大使館，就是襲擊無辜"。鑒於阿拉伯世界的和平革命，武裝鬥爭已經失去了意義。
扎瓦赫裡- 本拉登的得力助手
埃及人扎瓦赫裡(Aiman al Sawahiri)也在20年前薩達特遇刺之後受到法庭的審判。當時，扎瓦赫裡在監獄中接受電視臺的採訪時，向全世界公開表示： "我們是穆斯林，我們的宗教信仰超越意識形態和生活實踐。"
在這一思想的驅使下，八十年代中期，扎瓦赫裡在度過3年鐵窗生活之後去了阿富汗。在那裡，他後來成為基地組織的首席理論家和本拉登的得力助手。他的包裡裝著極端組織--"埃及伊斯蘭聖戰組織" 領導人賽義德·謝里夫（Sayyid al Scharif）的理論。 開羅金字塔中心的拉什萬（Diaa Rashwan）說："著名的謝里夫寫了很多關於武裝鬥爭的理論和實踐的重要書籍，總長超過1400頁，被世界各地的聖戰者視為開展武裝鬥爭的座右銘。在國際極端分子圈內，賽義德·謝里夫的名字很有份量。他是扎瓦赫裡的導師。兩人在1968年成立了伊斯蘭聖戰組織的第一個分支。"
多個伊斯蘭組織放棄暴力
儘管如此，扎瓦赫裡現在不可能指望基地組織的改組會得到埃及伊斯蘭聖戰組織的支持。該組織多年前就已經發誓放棄武裝鬥爭。賽義德·謝里夫呼籲全球聖戰者停止戰鬥。在眾多的書籍中，他從宗教的角度解釋了為什麼行使暴力的道路是錯誤的。
埃及的第二大極端組織，伊斯蘭集團（Gamaat al - Islamiya）也發誓放棄使用暴力。該組織的一個分支機構在1997年策劃實施了盧克索襲擊案，造成58人喪生。不久之後，他們便遠離了暴力。拉什萬說：
"他們的意識形態發生了根本的變化。伊斯蘭集團創造了一個全新的，不再與暴力有關的理論。他們仍然是伊斯蘭教徒，想引進伊斯蘭教法，但他們不再呼籲採取暴力行動。他們做好了參加民主進程的準備。 "
基地組織- 一個不斷擴散的毒瘤
但是基地組織的意識形態就好像是一個在不斷擴散的毒瘤。這個毒瘤的細胞還會造成巨大的傷害。恐怖主義的威脅依然存在。伊斯蘭問題專家阿納尼（Al Anani:）認為："巴基斯坦的本拉登支持者仍然非常活躍，他們有進行策劃和採取行動的能力。他們可能會襲擊西方目標。而且，位於阿拉伯半島的葉門的基地組織分支也和北非西部的基地組織一樣在繼續活動。"
