毛澤東對知識份子歷來不抱好感，把他們比作「臭老九」。僅57年「反右運動」就禍及中國近三分之一的知識份子，緊接著，「橫掃一切牛鬼蛇神」的「無產階級文化大革命」，沒受衝擊的寥寥無幾。學者認為，毛敵視知識份子，與他在當年「北大」受鄙視有關，也與他帝王思想下不能容忍有思想的人有關。
毛澤東把秦始皇簡單消滅肉體的「坑儒」，變成全國規模的「群眾運動」，由群眾來檢舉、揭發、批判、鬥爭，造成人人自危的態勢。從1942年的延安「整風運動」到「文化大革命」，幾乎每年一次。
毛澤東為什麼如此仇恨知識份子？
四川作家、右派維權代言人鐵流認為，毛澤東仇恨知識份子，與他「北大」經歷有關。鐵流表示，當初毛當圖書館管理員，一個月才8銀元，而胡適、李大釗等教授一個月400多塊銀元。有一次他抄圖書，因字跡太潦草受到批評，令他憤然離開北大。從此，他對知識份子結下了仇恨。
鐵流:「如果當時他也一個月拿一百多塊錢，他就不會上井岡山。如果當初他拿到400塊錢的話，他就一輩子教書了，一輩子當大學教授了，也許中國有另外一個局面了。歷史就是千差萬錯，結果從此結下了仇恨，所以他就憤然離開了北京大學圖書館。」
鐵流還從黨史專家李銳那裡瞭解到，毛澤東對自然科學非常反感，甚至仇恨科學。
鐵流：「57年反右一句話把他阻路了，羅隆基有句話：小知識份子跑來領導我們大知識份子。他聽了很氣。就這一句話，從而他仇視科學，仇視知識份子。他一生就是要整知識份子，非常霸道，非常霸氣。」
不過，著名經濟學家茅於軾認為，毛澤東鄙視知識份子，因為他認為他比任何知識份子高明。
茅於軾：「毛澤東對自然科學一竅不通，他不能完全理解現代科學對人類進步的作用，他認為他的想法超過任何人，甚至那些想法都沒有必要。對理科的知識份子，他認為只要發動群眾，世界上任何問題都能解決，用不著科學技術。」
歷史學家王來棣認為，毛澤東仇視知識份子，還來自他無產階級專政的帝王思想。他指出，接受過科學訓練和民主精神薰陶的知識份子，不願意盲目服從，並且追求民主自由，反對專制獨裁，他們繼承「天下興亡，匹夫有責」的傳統，關心國家命運，對國家大事好發議論，對政府領導人的行為評頭論足。毛澤東自然無法容忍這些不聽話的人。
翻譯家羅稷南曾向毛澤東提出一個大膽的問題，他說：要是魯迅今天還活著，他會怎麼樣?毛澤東回答：「魯迅──要嘛被關在牢裡繼續寫他的，要嘛一句話也不說。」
反右運動大獲全勝後的1958年，毛澤東更是得意忘形的號稱自己是「馬克思加秦始皇」，並自誇比秦始皇坑儒多一百倍！而且在坑儒的手法上他遠比秦始皇高超。
為此，鐵流認為，毛澤東把整個中華民族全埋葬了，把這個民族全毀了，而這個人要不批，不把他的影響徹底清除，中華民族就沒有前進的動力。
