当前，长江流域的水污染造成的危害日益明显，长江流域的水环境不容乐观。据资料显示，2000年与1999年相比，长江劣于三类水标准的河长占总评价河长的26％，比1999年上升了5个多百分点，上升态势明显，其中，长江沿岸排污口的排污是造成污染带的根本原因。1999年长江流域（包括太湖流域）工业废水和城镇生活污水为207亿吨，占全国废污水排放总量的近三分之一。
由于投入不足等原因，不少城市生活污水处理设施建设滞后，根本不能适应水污染防治的要求。随着重庆人口不断增加，全市生活污水排放量增多，去年底达4亿多吨，而全市仅有3个处理量较低的污水处理厂，全市污水处理率远低于全国平均水平。
同时，垃圾正严重威胁着长江和三峡库区的水环境。白色污染”不仅影响到长江水质，而且影响到国家重点水利工程的安全。1998年的特大洪水携带的大量垃圾，曾在葛洲坝前堆积成一道高度达2－4米的“垃圾山”，迫使电厂停机。此外，农业面源污染和船舶污染问题也日益突出，亟需采取措施解决。
长江流域500取水口受污染影响一些城市守着江水找水吃
靠近奔腾不歇的长江，但一些城市岸边却难以找到符合饮用水卫生标准的水源地。目前，由于水质型缺水危机，上海、重庆等城市正遭遇守着长江找水喝的尴尬处境。
长江流域水污染已对饮用水水质安全构成严重的危害。据统计,1999年长江流域（包括太湖流域）工业废水和城镇生活污水为207吨，占全国废污水排放总量的近三分之一。目前长江干流沿岸共有取水口近500个，都已不同程度地受到岸边污染带的影响，目前长江流域工业、城镇生活用水量约600亿吨，主要取自岸边，由于找不到符合饮用水卫生标准的水源地，不少城市被迫采用江心取水办法以改善饮用水质量。若都改从江心取水，需比原投资增加数十亿元
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