中国官方媒体开始说四百人中毒，后来下降到二百；新华社最初说死亡人数是四十一人，后又撤稿，十七日改为三十八人，同一天中国国际电台说是四十九人，中共在香港的大公报一度说是逾百人，而民间说是数百人。政府多数部门严守秘密，不回答记者的问题。
据多维社报道，南京市成立以市长罗志军为总指挥的现场总指挥部，除了进行善后处理及调查外，还勒令各大报刊统一口径，不准报导死亡人数。
中央电视台《新闻联播》报道称：南京汤山中毒人员有38人因抢救无效死亡。目前，除了６名重征病人外，其他中毒患者都已转危为安。部分中毒患者已治愈出院。
网友对此有质疑。有人指出：“因抢救无效死亡38人”，那么，那些根本没来得及“抢救”就早已确定死亡的死者，是不是就可以因为不属于“因抢救无效死亡”，而被排除在这公开承认的38人之外呢？！因此，有人认为从大陆官方报道的这一文字小把戏（为什么不敢理直气壮地说“中毒死亡人数目前统计已达38人”？）中，我们几乎可以断定南京特大投毒案的死亡人数绝对不止38人。政府到底想掩盖什么？
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