周正毅涉及的违规超贷、逃税及股市非法操作等问题，根据大陆媒体的报导，与中国银行香港分行总裁刘金宝的突然去职有关，目前中共中央纪律检查委员会、国务院银行监督管理委员会及监察部组成的联合调查小组，正对此案密集调查中。
业界认为，周正毅当年在抵押不足的情况下，从中国银行上海分行取得二十亿元人民币贷款，用于入主上市公司“建联通”（即“上海地产”），极不寻常，而刘金宝时任中国银行上海分行的行长。
《法新社》自上海报导，目前任教于香港中文大学的中共政治观察家吴国光认为，周正毅并不是中共高层党员，中共中央纪律检查委员会派员前往上海调查此案，是有中共高层涉入此案的一个明显讯号。
法国当代中国研究中心主任高敬文（Jean-Pierre Cabestan）更进一步指出：此案“一定是党内高层同意扩大调查，而调查触及的高层领导人甚至可能包含江泽民”。
厦门大学政治与行政学系教授朱仁显则表示，在大陆目前这种由计画经济过渡到市场经济的阶段，很难避免官商勾结的问题。
另据《亚洲周刊》报导，周正毅事件在上海政坛及商界引起震汤，目前周正毅已经供出包括地产商、金融及房地产官员二十余人涉案，其中甚至包括一名上海市人大副主任。此外，牵涉的贷款银行，除了已知的中国银行外，还包括建设银行、交通银行、工商银行等十多家银行在上海的分行。
据指出，此案的调查，得到中共前任总书记、现任军委主席江泽民的同意，案件更被定性为“建国以来最大的金融诈骗疑案”。此外，中共高层日前已向中纪委和监察部发布对此案要“一查到底”的指示。
关于中共政治局委员黄菊与此案的关系，美国《纽约时报》先前即指出，此案可能为黄菊的政治前途“投下阴影”，但当日大陆媒体就出现一则新闻简讯称，黄菊在中南海会见了外国企业领袖，藉此显示黄菊仍未受此案牵连。
另有北京政治观察家认为，在大陆各地都出现众多贪官污吏的情况下，上海反常地处于“唯我独清”的地位，而江泽民当年以“反腐败”的手段，将以政治局委员陈希同为首的“北京帮”拉下马，周正毅一案，因此可能与中共新领导层企图掀开上海腐败的盖子有关。
