进入2005年，中日之间已经多番过招。在2005年元旦日，日本首相小泉纯一郎并没有像2004年元旦一样前往供奉着甲级战犯的靖国神社，不过在日本国人面前，小泉依然是摆起了强悍的姿态。
中新网1月4日报道，日本首相小泉纯一郎辩解说，参拜靖国神社是他作为一名日本公民选择纪念逝者的权利。他又表示：“我不认为靖国神社是中日之间唯一的重大问题。”当被问及今年他是否以及何时去参拜时，小泉说他会在“适当”的时候下定决心。
日本共同社12月27日报导，日本政府内部有人主张：“若早早在年初完成参拜任务的话，到2006年9月自民党总裁任期结束前将不再进行参拜，这样就可以在这段期间着力改善同中韩的关系。”
新华社旗下《国际先驱导报》1月4日报道，主张元旦日参拜的人主要考虑到以下因素：日本政府打算今年3月日本爱知世界博览会之际邀请中国总理温家宝访日，而 8月又正值战败纪念日，中国国内的反日情绪可能因反法西斯战争胜利60周年而高涨，那时很难找到参拜靖国神社的一个好时机。
对历史问题，日本执政自民党一直给予小泉极大的压力，甚至公开提出“不去参拜就是向中国屈服”的论调。《国际先驱导报》报道指出，自民党干事长武部勤日前就表示：“如果不去参拜，就相当于向中国屈服。”法务大臣、时任自民党政调会长的麻生太郎曾就中韩两国对日本首相参拜靖国神社表示抗议一事指出：“这永远是个没完没了的话题，基本上我觉得还是置之不理为妙。”他认为日本方面没有必要主动平息事态。
在日本民间，仍有约一半百姓支持小泉参拜。日本共同社12月11日消息，据共同社舆论调查显示，关于小泉首相参拜靖国神社，认为“明年应该继续参拜”的人占到 51%，虽然邻国强烈反对，但赞成参拜日本民众仍占到了半数以上。只是，认为“明年应该放弃参拜”的反对者也仍然占到40.8%。
有一种意见认为，小泉顶住了党内和民间的这些压力，保持克制，元旦日没有去参拜，一定程度上是可以被视为善意的表达。不过，《国际先驱导报》也引述小泉周边人士预测：“2005年1月的新闻会很多，也许首相会尽量挑一个不容易被大幅报导的日子去吧。”所以，小泉的“善意”能否贯彻始终，现时仍是未知之数。
历史问题并不是中日关系唯一出现问题的地方。在此之前，日本批准台湾前总统李登辉在2004年12月底旅游日本，也引起了北京方面的不满。
对于有关问题，北京方面似乎并没有忍气吞声。日本共同社1月5日报道，日本执政自民党一个议员代表团被逼延期访华。据报道，应中国方面的要求，原定本月9日至12日自民党前政调会长额贺福志郎等执政党议员访问中国的日程目前已经延期。报道指，中方以“准备尚不充足”为由要求将之延期进行。
也在同一天，中国官方《人民日报》旗下的《环球时报》刊登了一篇文章，引述台湾亲民党立委消息指称：李登辉以21亿元新台币(下同，4元新台币约合1元人民币)的铁路合约换得这次旅游签证。
但是，若要说两国关系“陷入低点”，也并不尽然。共同社1月6日报道，小泉纯一郎6日上午（日本时间同一天下午）在印尼地震海啸重建援助紧急首脑会议召开地雅加达的会场内同中国总理温家宝进行了短暂的交谈，据日方透露，双方就在灾害救援领域加强合作达成了共识。
另外，新华社北京1月5日也报道，中国副总理曾培炎５日在人民大会堂会见了来访的日本总务大臣麻生太郎一行。双方就中日两国加强信息产业领域内的合作交换了意见。陪同麻生大臣来访的还有来自ＮＥＣ、富士通等多家日本跨国企业的负责人。
分析家指出，中日之间出现的互动传达了一个讯息，就是双方在短期内可能都会维持一种“政治冷，经济热”的互动关系。今后，中方对日方的行为，可能会作出适度区分，经济和人道的交流和合作会加强，但政治方面则会因应事件作出针对性的部署；经济和政治问题不会混为一谈。
中国在换届之前，处理对日问题时每每把经济问题和政治议题挂勾，例如对日采购也跟中日政治气氛有所关联。北京的原意是希望通过“以商围政”，让东京政府软化其在军事以至历史问题上的立场。不过，多年以来，中日经贸关系已经十分密切，但双方在政治上的分岐并没有缩小的迹象。
在经过微调的对日博弈中，北京采取了更具针对性的措施，例如日本执政党让李登辉访日，中方就以推迟执政党议员访华作回应；在历史问题上，日本首相小泉曾表示要每年都到靖国神社参拜，中国国国主席胡锦涛也在2004年4月30日至5月6日在江苏考察期间，参观了侵华日军南京大屠杀遇难同胞纪念馆，向遇难中国同胞表示深切哀悼，并在内部讲话中表明 “以后每次来南京，都会到纪念馆献花！”。
应该指出，中方并没有公开胡锦涛“以后每次来南京，都会到纪念馆献花”这一句，这也是说明，中方在对日问题上也是留有余地，并没有盲目地祭出民族主义的旗帜。
分析家又指出，在对日问题上
