纽约时报5月24日报导说，日本执政党自民党负责人安倍晋三称：“许多日本人可能感觉此举(吴仪取消与小泉的会晤)是粗鲁无礼的。”日本外务省发言人在被问道中方为何要取消此举会晤时表示：“我们也不知道。”
而中国外交部也没有立即解释吴仪突然回国的原因，但北京方面暗示吴仪突然离开日本可能与近日爆发的口蹄疫有关，而发现疫情的农场距离北京只有两个小时的车程。
纽约时报说，不管怎样解释，取消会晤都已表明这两个亚洲大国的关系近来已受到抑制：经济火热，政治寒冷。中国已成为日本最大的贸易伙伴和最大的投资国，为此吴仪23日在日本经济新闻社主办的演讲会上，找到向日本企业界演讲的机会，然后又同丰田公司社长兼汽车协会主席奥田硕共进午餐。
吴仪在演讲中说：“现在，中国和日本正面临着两国关系正常化以来的一个非常困难时期，如果我们不尽快扭转这种局势，它将损害相互的利益关系，也会伤害两国人民的感情。”
纽约时报介绍说，在中国爆发大规模反日示威后，日本首相小泉纯一郎于4月23日在雅加达与中国国家主席胡锦涛会面，欲修补两国正在恶化的双边关系。接着，便发生了此次的政治冷落。日本媒体称，中国国家主席胡锦涛在22日会见一个日本代表团时指出，两国的关系有可能会“毁于一旦”。
而导致两国关系再次紧张的最明显的原因是，日本首相小泉纯一郎每年都要参拜供奉着包括东条英机在内的二战明目甲级战犯的靖国神社。此外，靖国神社还供奉着过去150年中在侵略亚洲邻国时死亡的约250万日本人的亡灵。
在吴仪访问日本期间，中国外交部发言人孔泉在新闻例会上强调说，“目前中日两国关系最大的困难就是日本首相参拜靖国神社。”但日本外务省发言人在吴仪取消会晤后透露说，日本外交官员曾于23日询问了中方，想知道此次会晤的取消是否同靖国神社有关，但中方明确否认说：“没有关系。”
不过，日本首相小泉纯一郎当天则轻松地谈到“会晤取消”一事：“由于他们提出了此次会晤，它应该成为一个很好的机构。如果他们不想会晤，那就不需要了。”
纽约时报分析说，吴仪突然结束访日并回国，也可能与中国近日爆发的口蹄疫有关。国际先驱论坛发自北京报导说，北京一些观察家认为，除了口蹄疫外，突然取消会晤不太可能同其它“紧急有关”，因为吴仪除了负责对外贸易外，还兼管着中国的卫生部门，尤其是在萨斯疫情爆发以后。
报导最后指出，由于缺少北京附近爆发口蹄疫的相关信息，已再次令人质疑中国官方是否又隐瞒了疫情，象当初隐瞒萨斯疫情那样。
