蔡孟昆的投书中提到，即使重症病患因器官衰竭而命在旦夕，也不能为了救命而造成他人无辜的生命被戕害，为了救命而促成违法的犯罪事情发生。仲介境外器官移植的禁令是基于伦理与法律的考量，即使器官严重短缺是事实，器官移植也决不可以沦为一个简单的“市场供需”问题，而模糊了器官移植的医学伦理。
台湾台大医院外科主治医师蔡孟昆去年八月以一篇《伦理不分境内外》投书台湾媒体，近日他接受大纪元采访时表示，移植大家都太看重接受者这方的需求，可是我认为我们应该多看看捐赠者这面，“到底器官是怎么来的，捐赠的过程是不是合乎人性、合乎法律，在整个移植过程中器官的来源是很重要的，如果是不符合人性甚至是杀人的，那这个器官移植的医生就是刽子手”。
他强调，器官移植不只是要看手术品质，还要看器官来源是否是被强迫甚至是被谋杀的，如果是这样的移植不要做，是违背良心的。
专精肾移植的蔡孟昆投书内容提到，卫生署规范医师不得仲介境外器官移植，这不仅是它作为一个最高卫生主管机关该有的坚持，也是对于“医学伦理”的一种宣示。…..中国的器官移植在国际上早已声名狼藉，我们的卫生署规定台湾医师不得仲介境外器官移植，是宣示台湾谴责不人道摘取器官暴行的立场，同时也避免台湾医界沦为中国不当取得器官的帮凶。
肯定卫生署对移植医学伦理的规范
当初台湾卫生署公布对于医师仲介器官的规范，引来媒体与部分医界的抗拒声。其论述点以人有求生的权利，台湾器官短缺，病人到国外求取器官的机会，不应被阻绝。蔡孟昆鉴于这种论述有误导视听大众的担忧，而奋笔疾书写下铿锵有力的器官移植医学伦理不分境内外的看法，即便知道会承受不少压力，蔡孟昆说“当时不得不写，怕台湾医界对这个事情有所偏颇”。
卫生署2006年八月公告：医师或其他医事人员仲介民众赴境外进行器官移植，不论有无收取费用，或亲自带病人赴境外进行器官移植并收取酬劳者，都将依违反医学伦理或业务上不正当行为处分，重者废止执业、医师证书。
蔡孟昆肯定台湾卫生署发布的对于境外移植条例的规范，他说，无论是从死刑犯或法轮功学员身上的器官来源，台湾不希望从这样的情况去受益，卫生署提出严厉的惩罚我想绝大多数的医生都不会再去故犯。
据香港星岛日报网去年12月报导，中共卫生部副部长黄洁夫坦承，中国目前大多数移植用的器官确实来自死刑犯。蔡孟昆说，中国大陆最近被世界移植医学会施予非常大的压力，所以他们最近不得不做出回应，让死刑犯完全由法院来判决。即便是如此还是有相当大的问题。
中国的移植成果 无法在世界杂志发表
他说，世界移植医学会对大陆移植界有公开信，给所有的会员说明对于大陆移植采取什么样的态度，因为无论是从死刑犯或法轮功学员身上的器官，都是不符合医学伦理的，所以大家都不赞成。另一方面，世界移植医学会鼓励会员多跟大陆移植界交流，认为这可以导正大陆的做法。
他分析认为，至少他们（中国）开始做一些表面的规定，让他们的移植在台面上看起来还可以，事实上大陆的移植成绩完全没有办法在世界的杂志发表，这是医学会的态度，只要是从死刑犯或法轮功学员身上做的，所有的移植成绩不准在杂志上发表，所以中国不得不对这样一个类似惩罚的措施，做出很慢很慢的改善。
他无奈的表示，中国大陆的移植成绩要透明看到是相当困难的，因为整个资料、媒体都是控制在（中共）体制内，这个部分没办法解决，我们这边也只能透过多宣导让民众知道大陆移植的状况。
处理从中国移植回来的多是棘手案例
根据台湾媒体报导，目前台湾病患到中国进行器官移植出现问题，回台湾找医师治疗，仅台大一家医院，每个月就会碰到几例。
2个多月前受理了一位从中国换肾回来病患的医疗补救，棘手的处理过程，让蔡孟昆感慨的表示，在中国大陆的移植医院往往他们都以企业化来经营，当有病患要求要移植时，并不会全盘去考量对方是否适合移植，因为做了就会有收入，所以并不会去在乎病人移植之后是否能得到最好的效益。
当时该名约50岁到台大求诊的男病患已经在中国移植一个多月了，蔡孟昆医师述及当时的情况：大家（台大医护人员）看到都吓了一大跳，整个开刀的伤口都是没有愈合的，还不断有尿液从伤口渗出来，从来没有看过那么严重的伤口问题。“原来病人本身有糖尿病而且没有控制好”，这个令我们很头痛，即便我们给他进行手术修补，伤口愈合的机率也不大，但是加强控制他的糖尿病，用抗生素照顾伤口，病人还算稳定。
蔡孟昆表示，也许有的人去中国换的不错，但是常常我们听到的案例是不好的，甚至是在那边就死亡，我们也都会跟病人说去大陆移植的风险，所以真的去的不多。
他建议，洗肾可以维持一定的生活品质，也许比不上肾移植，但是在风险和整个安全的考量之下，去大陆真的要很慎重。
台大外科医师蔡孟昆也从病人那边听说到，在中国医院所有的动作都涉及到要付费，甚至听到连护士换药也是另外收费，他认为这种情况涉及到医德，还有医疗的品质。
移植非人人适合 两岸看医态度不同
他指出，在大陆当有病患要求要移植时并不会全盘去考量对方是否适合移植，因为做了就会有收入，对于病人移植之后是否能到到最好的效益，并不在乎；就以最前面的那个例子来说，病人因为糖尿病太严重并不适合移植，伤口很难愈合，出现并发症的机率很高。
他接着说，还有并不是肝脏肿瘤的病人都适合做移植，像是多发的肝肿瘤或者是已经转移的一样不适合做肝脏移植，因为移植之后复发或转移的机率都非常的高，甚至会缩短存活的时间，因为在抗排斥药物的使用下，肿瘤的复发非常的快速，这样对病人实际上是有害的。
前往中国移植 期盼病患多考量
蔡孟昆透露曾经因为病患的案例跟中国的医生通过电话，几次沟通给他的感觉都是“怪怪”的。
最近有个案例移植回来没多就，肾功能不太好，台大医生建议做切片检察，可是中国医生却透过电话就叫病人口服类固醇，台大医生认为病情的处里，不能仅单是病人透过电话就做一个单方向的判断，事实上大陆医生给这样的建议是有相当大的风险。
看诊经验丰富的蔡孟昆表示，现在病患普遍知道大陆移植的状况，所以在我的门诊有相当多的移植病患宁愿在台湾等也不愿到大陆去冒险；当然也有人自认为在大陆吃的开，所以也有一定比例的人会去，那我们也要多加努力让他们了解大陆的状况，再做决定。
