感情
不碰财色是"政治行规"
从票选"梦中情人"、"性幻想对象"到"最佳捐精人选"，甚至被陈文茜(台湾女"立委")点名为最想发生一夜情的马英九，从政以来一直是政坛人气最旺的女性偶像，从来没"出过事"，不过马英九说:"我不是柳下惠，美女坐怀我还是会乱，所以惟一能做的，是不给任何美女有坐怀的机会。"马英九年少时喜欢清纯可爱型的女孩，长大后觉得女人漂不漂亮并不太重要，他喜欢有智能，会思考的女人。
初恋:幼儿园里的单相思
马英九读幼儿园大班时，班上有位杨姓小女生，长得非常清秀，每每秀秀气气地浅笑，流露出迷人的稚气可爱。小女生梳了个小马尾辫，每天马尾辫轻轻摇晃，吸引了马英九偷偷的目光。
马英九回忆说:"一次参加一项活动后，小女生的脸庞微微渗汗，她轻轻扇着，表情美极了！"
毕业典礼那天，马妈妈去幼儿园参加，马英九向母亲吐露心事:"妈！我有个女朋友。"并偷偷指给妈妈看。毕业典礼后，杨姓小女生"渐行渐远渐无音，水阔鱼沉何处问"，少年马英九"夜深风竹敲竹韵，万叶千声皆是君，故倚单枕梦中寻，梦又不成灯又尽"。欧阳修的原句本为"万叶千声皆是恨"，但在马英九的心中，哪有恨，只有迷迷蒙蒙的一些思念，这种情怀，淡淡的纯纯的，很快就流逝过去了。
恋爱:三任女友全是偶遇
马英九情窦再开，是小学三年级的事，班上有位女生笑起来好可爱，马英九顿生"好感"，不过这段感情因为羞涩无疾而终。
大三那年，马英九参加一个校外活动，旁边坐着一位台北政大女生，两人攀谈起来，引燃了马英九生命中第一次爱的火花，也让马英九深尝第一次失恋的苦楚。
台大毕业后，马英九参加一项活动，旁边碰巧又是位政大女生，马英九第二次坠入情网。1972年10月底，马英九入伍服"预官役"，先在左营"海军陆战队"受训，再分发到左营的"后勤司令部科总库"担任"少尉补给官"，而这段感情也逐渐褪去色彩，升华为友情了！
1974年8月，马英九赴美就读纽约大学，在机场偶遇妹妹马莉君的同班同学周美青，又是一个政大女生。三次恋爱，全是偶遇，全是政大女生，这是马英九的爱情宿命，所以他到政大教书，感触格外深刻。
自律：每天"戒急用忍"
马英九的哲学是:"行有行规，每一行都要遵守行规。绝对不碰财与色，是政治行规，政治人物都应遵守。"据说，凡是女学生到教授研究室找他，马英九一定开着窗户开着门。女生请他在衣服上签名，马英九一定悬腕。
在马英九担任"总统府副局长"任内，有位担任护士工作的周小姐，有妄想症，妄想快要成为马英九夫人，所以无论打电话或写信，都以"马英九准太太"的身份自居，后来周小姐被送往医院治疗，但她后来拒绝做进一步疗程。在竞选领导人时，当有记者说有人在等他"出事"时，马英九幽默地说:"我每天戒急用忍，跑步、游泳、洗冷水澡，不会出事。"
家事
马英九与妻子周美青都是学法律出身，都理性而独立。两人育有两女，大女儿马唯中和小女儿马元中。3月25日，台湾女作家郜莹在博客中发文《马英九赢票靠妻子》，她认为马英九大赢的选票，一半是由他的妻子周美青为他赢得的！博主认为:周美青之所以赢得台湾选民，尤其是职业女性的认同与喜爱，是因为马英九起起落落风风雨雨，周美青始终低调地保持着自己的本色。
妻子
博文写道，马英九春风得意时，周美青从不会站在旁边沾光取宠。她也不像任何一位台湾领导人夫人或大官夫人，出现时翡翠耳环和名牌钻戒绕身。她不会强出头，而是默默地做好自己的事情。即使明知门口围着一堆记者，她依然一如往常轻装素颜准时现身上班去。
马英九胜选后的24日，周美青仍然像往常一样，穿着休闲装乘坐公交车上班，不同的只是身边多了几名随从以及大批记者。网友赞扬道:"衣着朴素、自立、自信、干练。毕业于美国哈佛法学系的她没有因为夫贵而妇贵，我欣赏她，一个独立坚强不依附男人的新女性，我想她是幸福的。"当然，也有网友"造型师" 建言:"作为一个领导人的妻子，会出席一些公众场合，还是要请专业单位给你包装一下，不要认为牛仔裤都好。"
也许是接受了大众意见，周美青25日即发表声明，暂不坐公交车上班。
女儿
21岁的马元中目前就读于美国布朗大学。据台湾媒体报道，她的英文丝毫不逊曾就读于哈佛大学的姐姐马唯中。在她的博客里，文章大多是英文写就。不过博客的话题天南地北，提到妈妈和姐姐，就是没有提到自己的父亲马英九。
在媒体的视野中，马元中一直是个刻意在公开场合与父亲保持距离的女孩。马英九当市长时，一次给台北表现优异的初中毕业生颁发市长奖，碰巧遇到女儿马元中也获此殊荣。马元中上台领奖时，马英九问"亲一下好不好"，害羞的马元中尴尬苦笑，连连说"不好！不好！"虽然从马元中的博客里"挖"不出马英九的儿女情长，但她还是透露了一些家庭"内幕"。比如提到妈妈时说，大概因为妈妈很少亲自下厨，所以当妈妈煮饭时她都会很开心，而她最爱吃妈妈煮的咖哩牛肉面、莲子银耳汤，"稀饭也很好吃"；她还写道:"我们家不吃青葱、不吃洋葱、不吃大蒜。"不过，在是非与猎奇交织的奇诡氛围下，这个名为 "yuanyuannana"的博客近日悄然关闭了。
特写
马英九是位运动不懈的男人，而且将运动变成了一件令观众尖叫的美事。他跑步，会穿紧身短裤；他游泳，会暴露两点，而且他以运动来锻炼自己的意志。
马英九的跑步哲学有"三不原则":不半途退出，不半途休息，成绩不退步。但马英九也承认，这"三不原则"也正是慢跑的"三难"。参加社会公益活动的经历中，马英九陪残疾人跑过步，在单位举办的慢跑活动中，也边跑边为"马迷"签过字。马英九成为名副其实的"慢跑明星"。马英九跑步最快的记录是:3公里，11分46秒。他每天睡前要做200个仰卧起坐，俯卧撑最高记录是连续做120个。
