头痛在小儿科是一个很常见的问题。小孩和大人不同，很多可能的病因须一一排除，尤其是婴幼儿和学龄前儿童，因为表达不易，有时表现的症状只是躁动不安，恶心、呕吐和揉触前额的动作而已，必须详加鉴别诊断。
一旦有反覆性的头痛，首先要排除其他生理的病症引起的问题，首先是五官科的疾病，如：耳鼻喉科方面的鼻窦炎，眼科的近视、散光或牙齿龋齿的问题，或是流行性感冒，甚至是其他感染，如：脑膜炎、脑部脓疡等。
而脑部问题引起的反覆头痛有可能是颅内压升高的第一表征，通常此种头痛在早晨起来或病人睡醒起来时最痛；起因于压力太高压到脑内的血管；此种头痛通常在前额和枕部最痛，原因包括脑瘤（特别是后颅窝脑瘤）、水脑、脑膜炎、脑炎、脑脓疡、硬膈膜下腔血肿块、慢性铅中毒、假性脑瘤（食性颅内压高）；其他原因如：动静脉血管畸型、动脉瘤、胶原性疾病、高血压脑病变、蜘蛛膜下腔出血、中风等，有赖于详细的神经学检查，及眼底检查。如果怀疑以上器质性问题引起的头痛，影像学如：核磁共振、电脑断层及其他相关的实验室检查是有必要的。
其次较常见是紧张型头痛，起源于压力或情绪的问题，和偏头痛较难以鉴别诊断。紧张型头痛很少出现在早晨，常见于下午傍晚，有压力或焦虑，睡眠不足时易发生，痛的时间较久，且易在一天内好好坏坏，多数的紧张型头痛在额部，但也有在顶部或枕后发生，起源于颞肌斜方肌群，咬肌的收缩，而很少有如偏头痛有脉搏跳动的感觉，也比较不会伴有呕吐或恶心感，一般紧张型头痛比较不需要做脑波或断层的检查。治疗原则是找寻造成压力或焦虑的原因并分享关心和了解，通常较缺乏自信和过度要求完美的小孩较易有此种头痛，除了再三保证其头痛非器质性的以外，可适度给予止痛药；必要时可做心理辅导。
最常见的头痛是偏头痛，其症状为搏动型头痛，有时伴有腹痛、恶心或呕吐，通常偏一侧，有时有先兆（如：看到闪光、感觉动作异常），在睡眠后会改善。偏头痛常有家族病史，大多数的偏头痛并不严重也不须服药治疗，最小的年龄是1岁左右，在国外的统计在7 岁到15岁的孩童盛行率约4%；女孩稍多，多半在10岁后会自愈，约有5%～20%的病童会变成成人型的偏头痛，遗传因素和血管不稳定是重要的原因，此外荷尔蒙变化、食物过敏，特殊如要求完美的个性、压力、亮的闪光、声音太大等则是诱发因子。神经传导物质Serotonin及Substance P被认为在偏头痛扮演很重要的角色。
偏头痛可分为一般型典型偏头痛、类偏头痛、丛积型头痛，但丛积型头痛很少发生于小孩。一般型偏头痛没有先兆，是小孩偏头痛最常见的，头痛是搏动型一阵一阵，发生于单侧前额或颞部，持续时间约1至3小时，但有时却可持续24小时之久，活动剧烈会增加疼痛，时而伴随呕吐或腹痛，因为误诊为盲肠炎时有所闻，其他症状如：脸色发白、畏光、肢体或其他感觉异常等，多半有明显的家族史(尤其是母亲那边)有时头痛会和其他的问题并存，如：焦虑、经期前后、排卵期前后、特殊的味道及食物、贪食症、成厌食症。
典型的偏头痛则为有先兆的偏头痛，由于较小的儿童不会描述，较少发生于年龄小的孩子。多半的先兆为视觉模糊、看到黑点或闪光、折射角度的光线，或东西变得忽大忽小；部分病人会合并有眩晕或呕吐的情形。其时须要和脑部长瘤或枕叶型癫痫做鉴别诊断。而类偏头痛包括阵发性呕吐、阵发性眩晕及阵发性意识混乱状态。 阵发性呕吐的症状是隔一段时日就会无缘无故的严重呕吐，有时甚至会脱水及电解质不平衡，有时会伴随腹痛，但很少发烧及腹泻，此时要先排除掉肠胃道或其他如代谢性疾病。眩晕及意识混乱也偶有伴随偏头痛发生。
复杂型偏头痛，如：脑干附近血管的收缩，或有时伴随局部神经学症状，如：走路不稳、眩晕、耳鸣、瞳孔大小不一、单侧肢体或脸部麻木感、失语等，在成年人较常见需先排除器质性的问题，但也有家族型的复杂偏头痛的病例报告，和一些基因的变异有关。
在偏头痛的治疗方面，主要是避免可以引起偏头痛的诱因，最常见是压力太过疲倦、焦虑。有一些孩子是被一些不实际的压力或父母过高的要求所困扰，如：学习较慢或是同侪的竞争力大，有些研究显示某些食物会引起偏头痛，如：豆干类、巧克力、可乐、热狗、辛辣肉类、牛肉干等。另外，避免强光刺激，太阳曝晒、过度劳累、头部外伤、吵闹声音、太饿、坐车或特殊药物等。如果有因果关系，通常在详细的神经学检查都正常后，给予适当的鼓励及卫教，症状有50%会逐渐痊愈，只有少数偏头痛的病人需要药物治疗。
药物治疗有分急性的治疗和预防型的治疗，急性的治疗在小孩常用的止痛剂，如：普拿疼及马盖先等，严重者可投于血管收缩剂、止吐剂。偏头痛非常严重者，或持续发作4～72小时以上才须用5-HT接受器Agonist，但小孩子仍很少用到。至于预防性的治疗的使用，原则上是患者每个月有2～4次以上严重的偏头痛，且影响到其日常生活时才考虑使用之。其他如：行为治疗、生物回馈，及自我催眠疗法，也有一些研究显示有一定的疗效。
