不過這項條約一直秘而不宣，引起海內外關注，外界質疑中共為了石油割讓土地、喪權辱國，中國網民的不滿，隨後，大陸網站開始禁聲，相關文章討論紛遭刪除。
*黑瞎子島屬於中國
黑瞎子島（黑瞎子是東北土話，意指黑熊）位於黑龍江與烏蘇里江之間的夾角地帶最東端，是黑龍江省扶遠縣的一部分，它扼守著黑龍江－烏蘇里江通航咽喉，水域產鱘魚等名貴魚類，對岸是俄羅斯遠東戰略要塞哈巴羅夫斯克市，俄軍視爲哈巴羅夫斯克的天然屏障，具重要戰略、經濟意義。黑瞎子島面積350平方公里，比中國當年與蘇聯浴血戰鬥守衛的珍寶島(面積僅0.7平方公里)大整整500倍。
按照1991年的中蘇國界東段協定，中國收回兩江主航道中心線中方一側的全部島嶼，理論上黑瞎子島屬於中國，但實際上中國並未取得該島主權。數十年來，黑瞎子島已經成了俄羅斯哈巴羅夫斯克市的一部分，俄方稱之為「大烏蘇里斯基島」，島上有俄國駐軍、農場、教堂，有浮橋與對岸的哈巴羅夫斯克市相連，俄軍炮艦駐守江面，阻止中國船只靠近該島。
*黑瞎子島疑劃歸俄
普京14至16日訪問北京，兩國領導人簽署的邊界協議不但涉及這些島嶼的最終歸屬，還明確規範雙方如何使用。雙方還約定不對外公開協議內容細節。同時大陸媒體並被要求對具體畫界內容不得加以報導。
香港《太陽報》18日報導，外傳中國已經徹底失去黑瞎子島的主權，只得到水道航行權。
中央社香港19日引述漢和防務評論代總編輯平可夫稱，根據未經中國和俄羅斯外交部證實的消息，中、俄在解決黑瞎子島劃界問題上，是以該島中線劃分國界。如果此消息屬實，則首先中國丟失了100多平方公里的土地，另一個關鍵問題就是，俄方是否從另外一半的黑瞎子島撤軍及其農場，抑或俄方仍然擁有使用權。
在19日的外交部例行記者會上，中共外交部發言人章啟月面對媒體兩度詢問，黑瞎子島目前主權歸屬何國，一律答以「中俄已就黑瞎子島的邊界走向問題達成協定」， 至於協定內容如何，則完全迴避，不予回答。
*海內外不滿 大陸禁聲
連日來引發海內外華人極端關切，民眾仍期待著條約真相，正如多名網友所標示的「我們都愛國，但我們也要真相，沒有人民的授權，政府可以隨便談判領土問題嗎？人民不知道真相，會讓大家認為妥協軟弱的政府是在悄悄以土地換和平」。
有些大學網站上還有網民諷刺中共為了石油犧牲土地，「以條約形式使北極熊的侵略合法化」。但是有關普京訪華的外電報導上，似乎看不到中國從俄羅斯方面獲得關於石油的什麼重大承諾。
面對網民的強烈反彈，中國當局立即封鎖網站。目前，內地網站的文章陸續被一一刪除，「中俄邊界」等詞語，已被中國眾多網上論壇列為禁止詞語，嚴禁發表討論中俄邊界問題的文章。
自由亞洲電臺報導，香港《開放》雜誌總編輯金鐘說，蘇聯十月革命以後，列寧曾宣布放棄對中國的不平等條約，但是中國自己不爭氣，忙著打內戰，到了斯達林上臺就沒得談了。49年以後，毛澤東不敢反抗老大哥，黑龍江邊界問題就擱著，但是毛澤東50年代訪問莫斯科，是承認蒙古獨立的。鄧小平時代主要是搞內政，對中俄邊界為題的態度是保持現狀，不收回，也不承認。
但91年江澤民訪俄和戈巴契夫簽定《中俄邊界東段協定》，幾乎完全按著現有的邊界劃線。金鐘說：「這批舊帳就被他勾銷掉了，這150多萬平方公里相當於40個臺灣的面積啊！」金鐘還表示，胡錦濤接班以後跟普京達成了邊界協議，事實上是肯定了江澤民對俄國人的讓步。
貴州異見人士曾寧認為，這件事情江澤民要負起最大責任。他說，江澤民的三件大罪，一是鎮壓法輪功，不但死人無數，也弄得現政權騎虎難下；二是應該為腐敗負責；三是他應該承擔他主政的這十三年裡面涉及到的領土主權的問題，這一點是肯定的。
金鐘認為：「還是一個權利和現實利益。換句話說普京從中國得到的好處遠遠超過中國從俄國得到的好處，那麼他為了什麼？最主要的是俄國可以把先進的武器供應北京，北京現在非常偏執的想增強他的武力，在對美關係中加大他的籌碼，加大對臺灣的軍事威脅。」
