感情
不碰財色是"政治行規"
從票選"夢中情人"、"性幻想對象"到"最佳捐精人選"，甚至被陳文茜(臺灣女"立委")點名為最想發生一夜情的馬英九，從政以來一直是政壇人氣最旺的女性偶像，從來沒"出過事"，不過馬英九說:"我不是柳下惠，美女坐懷我還是會亂，所以惟一能做的，是不給任何美女有坐懷的機會。"馬英九年少時喜歡清純可愛型的女孩，長大後覺得女人漂不漂亮並不太重要，他喜歡有智能，會思考的女人。
初戀:幼兒園裡的單相思
馬英九讀幼兒園大班時，班上有位楊姓小女生，長得非常清秀，每每秀秀氣氣地淺笑，流露出迷人的稚氣可愛。小女生梳了個小馬尾辮，每天馬尾辮輕輕搖晃，吸引了馬英九偷偷的目光。
馬英九回憶說:"一次參加一項活動後，小女生的臉龐微微滲汗，她輕輕扇著，表情美極了！"
畢業典禮那天，馬媽媽去幼兒園參加，馬英九向母親吐露心事:"媽！我有個女朋友。"並偷偷指給媽媽看。畢業典禮後，楊姓小女生"漸行漸遠漸無音，水闊魚沉何處問"，少年馬英九"夜深風竹敲竹韻，萬葉千聲皆是君，故倚單枕夢中尋，夢又不成燈又盡"。歐陽修的原句本為"萬葉千聲皆是恨"，但在馬英九的心中，哪有恨，只有迷迷濛蒙的一些思念，這種情懷，淡淡的純純的，很快就流逝過去了。
戀愛:三任女友全是偶遇
馬英九情竇再開，是小學三年級的事，班上有位女生笑起來好可愛，馬英九頓生"好感"，不過這段感情因為羞澀無疾而終。
大三那年，馬英九參加一個校外活動，旁邊坐著一位臺北政大女生，兩人攀談起來，引燃了馬英九生命中第一次愛的火花，也讓馬英九深嘗第一次失戀的苦楚。
台大畢業後，馬英九參加一項活動，旁邊碰巧又是位政大女生，馬英九第二次墜入情網。1972年10月底，馬英九入伍服"預官役"，先在左營"海軍陸戰隊"受訓，再分發到左營的"後勤司令部科總庫"擔任"少尉補給官"，而這段感情也逐漸褪去色彩，升華為友情了！
1974年8月，馬英九赴美就讀紐約大學，在機場偶遇妹妹馬莉君的同班同學周美青，又是一個政大女生。三次戀愛，全是偶遇，全是政大女生，這是馬英九的愛情宿命，所以他到政大教書，感觸格外深刻。
自律：每天"戒急用忍"
馬英九的哲學是:"行有行規，每一行都要遵守行規。絕對不碰財與色，是政治行規，政治人物都應遵守。"據說，凡是女學生到教授研究室找他，馬英九一定開著窗戶開著門。女生請他在衣服上簽名，馬英九一定懸腕。
在馬英九擔任"總統府副局長"任內，有位擔任護士工作的周小姐，有妄想症，妄想快要成為馬英九夫人，所以無論打電話或寫信，都以"馬英九准太太"的身份自居，後來周小姐被送往醫院治療，但她後來拒絕做進一步療程。在競選領導人時，當有記者說有人在等他"出事"時，馬英九幽默地說:"我每天戒急用忍，跑步、游泳、洗冷水澡，不會出事。"
家事
馬英九與妻子周美青都是學法律出身，都理性而獨立。兩人育有兩女，大女兒馬唯中和小女兒馬元中。3月25日，臺灣女作家郜瑩在博客中發文《馬英九贏票靠妻子》，她認為馬英九大贏的選票，一半是由他的妻子周美青為他贏得的！博主認為:周美青之所以贏得臺灣選民，尤其是職業女性的認同與喜愛，是因為馬英九起起落落風風雨雨，周美青始終低調地保持著自己的本色。
妻子
博文寫道，馬英九春風得意時，周美青從不會站在旁邊沾光取寵。她也不像任何一位臺灣領導人夫人或大官夫人，出現時翡翠耳環和名牌鑽戒繞身。她不會強出頭，而是默默地做好自己的事情。即使明知門口圍著一堆記者，她依然一如往常輕裝素顏準時現身上班去。
馬英九勝選後的24日，周美青仍然像往常一樣，穿著休閑裝乘坐公交車上班，不同的只是身邊多了幾名隨從以及大批記者。網友讚揚道:"衣著樸素、自立、自信、幹練。畢業於美國哈佛法學系的她沒有因為夫貴而婦貴，我欣賞她，一個獨立堅強不依附男人的新女性，我想她是幸福的。"當然，也有網友"造型師" 建言:"作為一個領導人的妻子，會出席一些公眾場合，還是要請專業單位給你包裝一下，不要認為牛仔褲都好。"
也許是接受了大眾意見，周美青25日即發表聲明，暫不坐公交車上班。
女兒
21歲的馬元中目前就讀於美國布朗大學。據臺灣媒體報導，她的英文絲毫不遜曾就讀於哈佛大學的姐姐馬唯中。在她的博客裡，文章大多是英文寫就。不過博客的話題天南地北，提到媽媽和姐姐，就是沒有提到自己的父親馬英九。
在媒體的視野中，馬元中一直是個刻意在公開場合與父親保持距離的女孩。馬英九當市長時，一次給臺北表現優異的初中畢業生頒發市長獎，碰巧遇到女兒馬元中也獲此殊榮。馬元中上臺領獎時，馬英九問"親一下好不好"，害羞的馬元中尷尬苦笑，連連說"不好！不好！"雖然從馬元中的博客裡"挖"不出馬英九的兒女情長，但她還是透露了一些家庭"內幕"。比如提到媽媽時說，大概因為媽媽很少親自下廚，所以當媽媽煮飯時她都會很開心，而她最愛吃媽媽煮的咖哩牛肉麵、蓮子銀耳湯，"稀飯也很好吃"；她還寫道:"我們家不吃青蔥、不吃洋蔥、不吃大蒜。"不過，在是非與獵奇交織的奇詭氛圍下，這個名為 "yuanyuannana"的博客近日悄然關閉了。
特寫
馬英九是位運動不懈的男人，而且將運動變成了一件令觀眾尖叫的美事。他跑步，會穿緊身短褲；他游泳，會暴露兩點，而且他以運動來鍛練自己的意志。
馬英九的跑步哲學有"三不原則":不半途退出，不半途休息，成績不退步。但馬英九也承認，這"三不原則"也正是慢跑的"三難"。參加社會公益活動的經歷中，馬英九陪殘疾人跑過步，在單位舉辦的慢跑活動中，也邊跑邊為"馬迷"簽過字。馬英九成為名副其實的"慢跑明星"。馬英九跑步最快的記錄是:3公里，11分46秒。他每天睡前要做200個仰臥起坐，俯臥撐最高記錄是連續做120個。
