浙江省疾病預防控制中心消毒殺蟲所副所長魏蘭芬說，微波爐在工作時，微波與光波同時以30萬公里／秒的速度進行裡外交錯加熱，溫度可迅速達到 120℃，相當於高壓蒸氣滅菌的溫度。試驗表明，一定強度的微波能在3分鐘內殺滅大腸桿菌；6分鐘內殺滅導致腹瀉、結腸炎的病菌。
微波爐雖有很好的殺菌功能，但在使用時還有很多注意事項。
餐具消毒應先用濕毛巾包裹。由於微波爐內溫度過高，容易將餐具烤焦，降低殺菌效果。因此，在消毒前，最好先將餐具用濕毛巾包起來，再放入微波爐中加熱。
書刊消毒，旁邊放杯水。為了防止紙張變黃烤焦，在對書刊消毒時，應在爐腔內同時放杯水，加熱30-60秒即可。
保鮮膜別接觸食物。在使用微波爐對食物加熱殺菌時，不要讓保鮮膜直接接觸食物。因為保鮮膜在高溫下會融化，產生毒素，損害健康。可將食物放入大碗中，用玻璃或瓷器蓋住，這樣可將水汽封住，使加熱迅速均勻。
牛奶、油炸物不能加熱。因為牛奶中的氨基酸經微波爐加熱後，一部分會轉變為對人體有害的物質；而油炸物在高溫下使油飛濺，導致明火。如不慎引起爐內起火，切忌開爐門，應先關電源，待火熄滅後再開門降溫。
值得注意的是，不是所有餐具都適合用微波爐消毒。金屬餐具一定不能放在微波爐中加熱。因為金屬餐具在加熱中，會損傷到微波爐中的磁控管。磁控管是微波爐中的核心控制項，如反覆受損，其壽命就會縮短。仿瓷餐具也不適合加熱，容易開裂。
此外，加熱時間也很重要。一般情況下，餐具在高火下轉1-3分鐘即可達到消毒效果；清洗過的廚房抹布，只需放入微波爐中加熱1-2分鐘；口罩、毛巾應加熱3-4分鐘。這些物品在經過微波爐消毒後，最好再用清水洗一遍。
最後，還要提醒大家，微波爐應放在乾燥、通風的地方，爐子背部、頂部和兩側應留出10厘米以上的空隙。爐內如有異味，可用一碗醋在爐內煮沸，數分鐘後異味就會消除。
