進化論的重重危機
一八五九年，達爾文在《物種起源》中根據一些零散的事例，鮮明地提出了進化的觀點，認為今天複雜的生物界是從簡單的原始生物一步步進化而來。不過歷史好像總要在重複中循環前進。隨著科學深入廣泛的發展，歷史流轉到今天，昔日被進化論「解決」了的問題又轉了回來，許多人發現進化論的問題後，重新陷入古老的疑問：生命到底從何而來？近二十年，大量的事實發現使進化論陷入了真正的危機。眾多的科學發現使真理的天平明顯地向人們意想不到的地方傾斜了。
（1）脆弱的邏輯基礎
比較解剖學，暴露了進化論的邏輯錯誤──循環論證
科學上，如果一個理論的證明違背邏輯，這個理論就不能成立，但是人們對進化論的邏輯錯誤卻不予深究，也是因為深究起來，就沒有證據可言了。許多人聽到這話感到很驚訝？其實，問題的揭示會使你更驚訝。用比較解剖學來論證進化學說，形象地說就是：「如果人是猿進化來的，人和猿就會有許多相近的特徵；因為人和猿有許多近似之處，所以人就是猿進化來的。」這是典型的「循環論證」，前面在邏輯上沒問題（當然，邏輯上沒問題不等於合乎事實），後面就是狡辯了。換一個通俗的說法更清楚些：「如果甲是乙的弟弟，甲就比乙小；因為甲比乙小，甲就一定是乙的弟弟。」一聽後面就不對，因為甲比乙小，可能甲乙沒有任何親緣，還可能甲是乙的叔叔呢（如果甲輩份大）。循環論證在邏輯上是不能成立的。
然而進化論是歸納法嗎？不是，太多事實歸納不進去
有人曾說進化論是歸納法，這種邏輯思路稍微難一些，其實也好理解。歸納法就是提出一個命題，如果能把涵蓋的所有問題都歸納進去，那這個命題就是真理。然而對於進化論，太多的事實歸納不進去！從前面的史前文明證據來看，從進化的速度、物種爆髮式的產生的方式、進化的概率等等許許多多不但歸納不進去，而且在在都否定了進化論，可見進化論的論證作為歸納法是不能成立的，其實還是循環論證。
似是而非的「循環論證」貫穿了整個進化論，人們似乎都對此習以為常了。然而當我們嚴格地分析起來，都會大吃一驚！即便不十分懂邏輯的人也能發現這種證明是在詭辯。
今天，站在對生命本質有了比較深入認識的水平上再看進化論，達爾文用作證據的事例就顯得比較牽強了，論證也談不上嚴謹了。為什麼這麼說呢？我們舉個例子。在《物種起源》的第一版中，達爾文發表了一個大膽的設想。他認為一種熊可以下到水中，變成水生動物，最後變成像鯨那樣巨大的生物。所以他講，只要有足夠的時間，通過自然選擇，熊可以變成鯨。在以後的修訂版中，達爾文把這個說法去掉了。他重新考慮後，認識到沒有具體證據來證明，所以就刪去這一條說法了。有趣的是，他的這個熊能通過自然選擇變成鯨的觀點，正是整個進化論的中心點──一個物種可以變成另一個物種。而且，鯨魚進化的說法也沿用至今。從達爾文去掉這個例子這一點，我們也可以看到他對自己這個理論有一定保留意見甚至是疑惑。
（2）概率計算否定了進化論的核心──基因突變機制：
達爾文時代，近代西方科學正處於奠基階段，對生命現象的認識還很膚淺。那時的人看到了家養動物的諸多雜種變異，就認為物種也能這樣變成其它種，這就是進化。後來，隨著基因的發現和深入研究，學者們才意識到如果基因不發生根本的變化，不管後代表面與祖先有什麼差異，也沒有進化意義。然而基因又是極其穩定的，只有不正常的「基因突變」才能使之發生改變，那麼「基因突變」也就成了現代進化論的核心了。這是現代所有的進化論者公認的。這裡，我們就集中分析這個核心理論。
物種基因的穩定性極難逾越
基因的穩定性是物種保持自身穩定所必須的，同一物種不同個體的基因交流，並不能使此物種變成其它物種。動植物育種專家都知道，一個物種的變化範圍是有限的。最終，培育出的品種不是不育，就是又變成原來的親本。哈佛大學的梅爾教授稱之為基因體內平衡。最常見的就是狗再怎麼雜交育種還是狗。這說明進化論有一個無法跨越的障礙。在理論上，人們把突破這個障礙的可能性寄望於基因突變，這是唯一的可能了。
理論和實際上，基因突變產生高級性狀的機率幾乎是零
基因突變，是一種在基因複製或修復損傷等過程中發生的隨機錯誤，所以又叫隨機突變，本身就是一種病態現象。它發生的機率非常低，大約在萬分之一到十億分之一之間。低等原核生物的突變率較高，大約為千分之一，而高等類型的生物中，許多基因的突變率是十萬分之一到一億分之一。
基因突變能否產生高級特徵（性狀）呢？對基因的深入研究發現︰這種情況發生的機率極低。我們知道一個基因的核心是由幾百到幾千個鹼基排列而成，四種不同的鹼基按照一定規則排列，不同的排列順序形成了非常複雜精密的遺傳密碼。既然基因突變是隨機的差錯，我們可以用一個簡單的例子來分析──
我們來考慮一下這個問題：一個複雜精密的電腦程式，隨意的改動一兩個字元能夠產生更高級的程式嗎？當然不能。基因突變也是這樣。差錯造成的突變一般是單個鹼基的變化，這種變化造成的結果往往是各種缺陷、畸形、致死，在自然條件下具有生存優勢的沒有發現一例。為了增加突變率用於研究，科學家們使用了各種方法增加突變的機率，製造了大量的突變體，也沒發現向高等方向進化的類型。
概率計算表明，生物進化的可能性小到了絕對不可能的程度
現代進化論用基因隨機突變假說解釋進化的根本原因。我們知道這種突變具有隨機性、低頻率和不定向等，值得注意的是：在數學公式和模型普遍應用於生物學領域的今天，進化論者並沒有提出一個全面的公式，計算從基因突變開始到一次進化實現的機率，這是為什麼呢？讓我們繼續往下看。
有許多學者從基因突變發生的機率出發，計算出了產生新物種的概率，發現小得驚人。貝希（Behe, M.J.）的《達爾文的黑匣子》（Darwin's Black Box）一書中，美國生物化學家貝希以血液凝固的一系列生物化學機制為例，講述如此複雜精密的生命現象不可能是進化出來的。其中一個蛋白（TPA）產生的機率是十分之一的十八次方，經過計算至少需要一百億年才能發生。如果同時進化出和它相互作用的蛋白，機率就是十分之一的三十六次方。他說：「很可惜，宇宙沒有時間等待。」
這裡我們提出一個寬鬆的公式，根據突變機率計算進化產生新物種的概率（P）：
P=(M ×C ×R × E ×S) n
通俗地說，就是一個物種的某個體發生了突變（機率M=0.001），並且突變後的基因與自身其它基因在不同層次的產物上可以相容（寬鬆估計C=0.01），而且在生存競爭中該個體能夠存活，有繁殖的機會（R=0.1），而且突變恰好有縱向進化的意義，也就是有益的進化（這種情況至今沒有發現，某些進化論者估計為E=0.001）；而且突變基因在種群中能夠穩定下來得以擴大（寬鬆的估計為S=0.1）；因為新物種的形成需要一系列新基因的出現，假設要十個（冪指數n=10，實際物種間絕對沒有這麼小的基因差異），那麼進化出一個新物種的概率為：
P =（0.001×0.01×0.1×0.001×0.1）10=10-100
按照一年繁殖十代，種群（意指生活在同一地點的同種生物個體的總和）個體數為一千，相應的進化所需要的時間極為寬鬆的計算也需要「十的九十六次方」年。目前科學家認為宇宙年齡不會超過二百億（二乘十的十次方）年，進化一個新物種的時間，是宇宙的年齡的自乘約九·四次，足見進化是絕不可能的。
生物最相近的物種也不可能只差十個基因，高等生物和低等生物基因更是差別上萬，因此生物從低等到高等進化所需要的時間根本是無法想像的了。(待續)
