阿爾寨石窟寺位於鄂托克旗棋盤井境內，距旗政府烏蘭鎮130公里，距烏海市50公里，距109國道100公里。石窟寺所在地為低緩丘陵地貌中的一座孤立突起的平頂紅砂岩小山，地質面貌獨特，平面形制不太規整，東西長約200米，南北寬約70-90米，山頂海拔高度1460米，與周圍的高差約40米。阿爾寨（百眼窯）石窟寺是內蒙古自治區境內發現的規模最大的石窟寺建築群。現存65窟，洞內的壁畫傳遞了蒙古人信仰、生活的非物質文化遺產；其中以反映成吉思汗作戰場景的壁畫最為珍貴。大量的早期回鶻蒙古文榜題，其內容涉及佛經及世俗生活，是目前世界上發現回鶻蒙古文榜題最多的一處遺址。它不僅是內蒙古自治區境內規模最大、內容最豐富的石窟寺，也是我國規模較大的西夏至蒙元時期的石窟寺。阿爾寨（百眼窯）石窟寺保存的大量珍貴壁畫和回鶻蒙古文榜題，引起國內外學者的高度重視。
據《蒙古秘史》記載，1226年秋，64歲的成吉思汗仍然雄心不已「去征唐兀（西夏），以夫人也遂從行。」秋冬之際，成吉思汗率大軍南下渡過黃河，在鄂托克旗與西夏軍隊隔河對峙。成吉思汗率部下在阿爾巴斯山圍獵野馬，坐騎受驚，成吉思汗不慎墜馬受傷，在阿爾寨石窟養傷。《蒙古秘史》中說，「冬，間於阿爾不合地面圍獵，成吉思汗騎一匹紅沙馬為野馬所驚。成吉思汗墜馬跌傷，就於搠斡爾合惕地面下營。」據專家考證，「阿爾不合」，就是現在的阿爾巴斯；「搠斡爾合惕」，蒙語意為「多窟匯聚之處|」，而蒙古高原石窟甚少，堪稱「多窟匯聚之處」的，目前發現的僅有阿爾寨石窟。
阿爾寨石窟東南側的10號石窟為成吉思汗養傷時所住。該石窟的門前，樹有代表成吉思汗戰無不勝的蘇勒德神矛，門旁刻有一座西夏風格的佛塔浮雕，門前的石崖邊上鑿有兩道豎壕，據說是為方便成吉思汗養傷時坐著射箭所鑿。
在第28號窟中，西面牆上有一幅壁畫。有的專家認為是「蒙古族喪葬圖」，鄂托克旗旅遊局編製的《鄂托克旅遊》中介紹是「蒙古貴族喪葬圖」，阿爾寨石窟文化保護所製作的說明牌上介紹的是「蒙古帝王喪葬圖」。
整個壁畫為梯型結構，最上面兩層繪有山川、河流、原野，並在突出位置繪有兩軍對壘、激烈作戰的場景，可以還原為成吉思汗征西夏作戰的場面。
第三層左側繪有若干匹白馬，一匹褐紅色馬，及若干峰駱駝，應是表現成吉思汗在阿爾巴斯獵野馬時，所乘「紅沙馬為野馬所驚，成吉思汗墜馬跌傷。」右側繪有兩座白色蒙古包，尖頂高聳，其左側有一間寺廟，一間宮殿，宮中繪一婦人，似在垂首痛哭，應是表現成吉思汗逝世，隨行的也遂夫人悲痛不已的。阿爾寨石窟山頂平臺之上，原有宮殿、寺廟，皆毀於林丹汗西征鄂爾多斯之役，現仍存有遺址地基。其5號遺址的地基為圓型，是一較大型蒙古包的基礎。6號遺址與5號相連，是一方型地基，較1號、2號遺址面積小得多。1號、2號遺址原為宮殿、寺廟，且位置居中，5號、6號遺址既然相連，又有區別，其功能應是相關且又有區別的。
壁畫中部，繪有三人立於一棺木之後，左側男子著盛裝束袖袍服，關戴盔型圓帽，在其右側站立的似為二位僧人，應為隨同成吉思汗征西夏的托雷王子及為成吉思汗祈禱的僧人。木棺頭寬尾窄，由一根圓木中間剖開而成，棺木年輪較清晰，木棺中間有三道箍。三人身後，繪有方形墓壙，其中伏著一具屍體，有四只白鶴用嘴將屍體銜起。墓壙右側有一位僧人跪著，為逝者唸經超度。
阿爾寨石窟山頂平臺西北處，有一人工開鑿的坑道，北側連一石窟，據介紹是成吉思汗養傷時的住所。而且在阿爾寨各石窟中，此窟夏秋季節最為陰涼。那麼，既然前有10號窟，上有蒙古包、幕帳，此為什麼還要開鑿一個地面以下的石窟呢？在108眼阿爾寨石窟中，這眼窟是最特殊的。別的窟均是依山勢在側面開鑿，唯獨這眼窟是挖進地面以下，然後開鑿的。這眼窟也是最耐人尋味的——是否此窟即壁畫中之墓壙，曾為成吉思汗逝世之後的停靈之所呢？
在第31號窟內西側壁上，亦有一幅場面宏大的壁畫，人物繁多，極其耐人尋味。此畫上部，約佔整個畫面五分之三的部分，繪有一尊藏傳佛教的密宗法王，怒目金剛，神氣活現，極其威猛。畫的下半部，繪有一百餘各色人物，分為四組。
第1組共8人，為一地位尊貴，接受眾人跪拜尊崇的大家庭。其中心人物為一位身材魁梧、頭戴四方瓦楞帽，身穿盛裝蒙古禮服的男子。他盤腿而坐，右手舉在胸前，左手置於腿上。其左側為一位貴婦人，著蒙古禮服，戴固姑冠，坐姿與男人相同，頭也側向男主人。侍坐於男人右側的為二位貴婦人，均著蒙古禮服，頭戴固姑冠，但坐姿不同，均只盤右腿，左腿收回半立，雙手癒合十於胸前。男主人左側，另有四位蒙古男子，年少無冠，著禮服，均只盤右腿，收左腿，雙手合什。這8人毫無疑問為蒙古族的顯貴之人，那麼，他（她）們是誰呢？
據巴圖吉日嘎拉先生分析，魁梧男子當為成吉思汗，左側貴婦人為正夫人孛兒帖•兀真皇后，其左側的四位年輕男子為術赤、察合臺、窩闊臺、托雷，皆為孛兒帖夫人所生長；成吉思汗右側的二位貴婦人，為也速干皇后、忽蘭皇后，因為是側夫人，所以坐姿與正夫人孛兒帖皇后不同。
這8個並排坐於白色的高臺之上，接受人們的禮拜。高臺之下，呈品字型端放著三臺豐盛的祭品。中間的為主供，置於高臺之上，上罩紅色傘蓋；其兩側為副供，均置於紅色托案上，為全牲之祭品。三臺祭品狀若三座山峰，令人想起成吉思汗每年陰曆3月21日春季馬奶祭所用九九八十一隻羊背子，以及蒙古宮庭酢馬宴所上的全牛席，其含義不言而喻。
第2組人物約為10位蒙古婦女，均穿禮服，由一位頭戴固姑冠的貴婦率領，跪坐於白色高臺右側下方。這組人物，應是成吉思汗之妃也遂皇后帶領的嬪妃們。
第3組人物約20位著禮服的男子，位於第2組人物下側，一座山將其與第2組人物分開。這些男子由一盛裝男子帶領，向台上8人行彎腰禮。這些男子中有騎著馬，像從遠方趕來的樣子，其後部繪有山川，人群在山谷間形成只見頭不見尾的隊列。
第4組人物位於高臺左下方，約有20位盛裝男子，跪拜或盤腿而坐，雙手合十，向台上行禮，似為成吉思汗的重臣、干將（如四傑、四狗等），在向大汗行崇拜之禮。
據考證，在甘肅酒泉西南文殊山青衣寺（即文殊寺），有一塊元朝泰定三年所刻《有元重修文殊寺碑銘》，為成吉思汗次子察合臺後裔南答夫失所刻，碑文說：「金轉輪王皇帝南瞻部洲，為世之主，位傳於成吉思汗皇帝……」絲綢之路上的這段碑文與內蒙古草原上的這幅壁畫，遙相呼應，從宗教角度，認為成吉思汗為密宗法王下凡，可以相圓兩說。
