一九九二年三月的七届人大例会上，杨白冰率先喊出“为改革开放保驾护航”的口号，何其宗在总参系统率先响应。当时的江泽民虽然表面上不动声色，但内心对何其宗反感到什么地步，可想而知。
十四大召开前夜，江泽民和李鹏终于说服邓小平下决心削去杨家兄弟的军权。在此之前，杨家兄弟主持的军委领导班子换届名单中，比何其宗年长九岁的徐惠滋已被列为总参谋长继任人选，何其宗则递升第一副总参谋长。虽然因为倒杨倒得太晚，十四届中委和候补中委候选人名单已经来不及更动，但江泽民却成功征得了邓小平同意：接替迟浩田总参谋长职位的人选不能再按照杨家兄弟的安排执行。于是，便有了张万年的喜出望外、受宠若惊。
十四大召开时，何其宗顺利过了候补中委的选举关，但大会刚刚闭幕，江泽民即将他列入对杨家势力进行政治清洗的第一批名单，其中包括杨家兄弟主军时代陆续任命的三名副总参谋长：何其宗、徐信（当时兼任总参党委副书记）和韩怀智（对总政治部的清洗情况见本书徐才厚部份）。这三人里徐信和韩怀智均是用年龄理由劝退，唯有当时才四十九岁的何其宗是被明确宣布降级使用。
一九九二年十一月初，何其宗被刘华清召见，向他宣读了江泽民签字的任免令，要求他三天之内到南京军区报到，职务是排名最后的副司令员，级别由正大军区级降至副大军区级。
此后，虽然南京军区司令员已经因为年龄原因换届，但继任人选绝对不可能考虑何其宗。不过，按照法律条文，即使何氏不能获升，到十五大召开时才五十四岁的何其宗在副大军区岗位上还可继续服役九年时间。仔细对照一下就不难发现，与何其宗年龄相仿的十四届中央候补委员，绝大部份或是在十五大上继任候补中委，或是升任中委。而江泽民断然将何其宗的名字从十五届中央委员和候补中央委员的名单中剔除，显然就是要断绝他政治上东山再起的念想。
郭伯雄日后被任命为常务副总参谋长到总参谋部上任时，使用的就是当年何其宗使用过的办公室。高新《领导中国的新人物─中共十六届政治局》
