台湾负责海岸警卫任务的行政院海岸巡防署星期六动用了近40艘舰艇和近千名巡警在高雄港举行了一次海上反恐演习。身着红色标志的恐怖分子劫持了一艘台湾油轮，但在海巡署特种部队的打击下，这些恐怖分子很快被击毙或者被逮捕。
*陈水扁：大陆做法影响两岸关系*
陈水扁总统主持了这次演习。他说，海巡署不只是打击走私和偷渡，还要捍卫台湾的领海权。陈水扁说：“近来经常发生中国大陆海洋研究探测船擅自驶入我国专属经济海域，借研究海洋工作之名行收集我国海域周边相关情资之实。”陈水扁说，这不但侵害台湾的海域管辖权，对两岸关系更带来负面影响。
最近接连发生中国探测船进入台湾海域的事件。在5月24号一度在台湾舰艇柔性劝离下离开的中国国土资源部的“奋斗四号”星期四又再次返回距离高雄1百多海里的水域。台湾海巡署立即派遣三艘舰艇前往驱离，并授权第一线指挥官现场酌情处理，在劝阻不停的情况下可以强行登船。这艘中国探测船星期六已经离开台湾海域。
*许惠佑：将采取强制性驱离措施*
海巡署署长许惠佑说，台湾政府绝不容许中国船只在台湾领海作业，海巡署将采取强制性的驱离措施。许惠佑说：“中国的探测船在台湾四周出现当然不是什么新闻，但是，在东沙海域进行勘探这是首次见到，我们担心后续情况的发展。
记者问：“如果以后再有中国的船出现会怎么样呢？这次就我理解海巡署是比较克制的。”许惠佑说：“我们会顾及到海上的人命财产安全，当然多少要考虑到两岸关系的互动和国际形势的发展，但是我们执法的决心是不会改变的，也就是说，我们一定会把他们请走，离开我方海域。”
曾经担任过台湾海基会秘书长的许惠佑说，海巡署三次透过海基会致函大陆海协会要求船只离开台湾海域，但到一直没有收到对方的回应。
*许惠佑：大陆偷渡客现象已大为改观*
除了驱赶中国大陆船只以外，海巡署的另一项主要任务是打击偷渡。前些年，大陆偷渡客现象一度近乎失控，但是，近年来这种现象已经大为改观。
许惠佑说，以2002年到2004年的统计为例，大陆偷渡客就减少了大约一半。许惠佑说：“台湾跟大陆实在太近了，最近的地方只有67海里，所以一般的渔船和快艇越过中线。但是在我们的努力之下，偷渡客还有走私都减少。”许惠佑说，在2002年的时候还有3千多人，到了2004年的时候只有1千7百多人。
