南京秦淮河常年垃圾泛滥，水质因垃圾腐烂发酵而严重污染，鱼类濒临死亡，腐臭气味令游人掩鼻。
一提起秦淮河，人们会想起唐朝诗人杜牧"烟笼寒水月笼沙"的诗句，以及近代文人俞平伯的散文"桨声灯影里的秦淮河"。看到最近媒体上有关南京秦淮河水遭受严重污染的报道，人们不敢相信，这些报道所说的，就是杜牧和俞平伯笔下那条可以让你心魂荡漾的秦淮河。
上海东方网一则报道说，站在秦淮河入江口，你会发现，严重污染的长江水，比起呈暗黑色的秦淮河水来，还算是清澈的。
美国特拉华州环保专家高放博士表示，垃圾污染不独是南京秦淮河的问题，而是中国城镇普遍存在的问题。他说，中国迄今还没有找到解决垃圾污染的办法： "秦淮河很漂亮，我去过那里。其实垃圾问题不只是南京的问题，实际上是所有中国大中型城市都算在内，甚至是农村镇、县一级的地方都有的问题。总的来说，我自己觉得这垃圾问题，中国实际上还没有找到一个合适的办法来处理垃圾。象北京、上海这些大的城市可能会好一些，市内的垃圾运到城外，有的是填埋，有的是焚烧。现在从整个国家来讲，没有找到一个很好的处理办法。最近这些年，好像各地不少垃圾焚烧。其实烧掉是一个办法，但是，目前的焚烧技术主要的一个问题就是产生二次污染。"
环保组织"绿色江河"负责人杨欣也表示，中国的江河湖泊普遍遭到污染："中国的很多的城市河流都存在同样的问题，很多的河流都是属于被污染的河流。不管是秦淮河，包括其他的城市，比如说武汉的河流、武汉的湖泊、成都的周围河流、像昆明滇池等等湖泊都遭到了很严重的污染。但这种污染跟经济的发展，还有污水的治理程度、密度，是分不开的。"
杨欣说，中国的垃圾治理治标不治本，只从局部景观着眼： "虽然这些年政府做了这些方面的努力，特别在水环境的治理方面也投入了很多的金钱，但在治理过程中可能是追求一些表象的、景观的一些环境，并没有完全从根本上彻底地治理。这个河害的来源不仅仅是南京，还有其他地方来的，上海还有几十公里长。南京城里面可能是治理住了，但是在它的上游地区就没有。很多地区，特别是像农村，他们有把垃圾倒到河边的习惯，河水一涨就把垃圾冲走了，我这儿反倒干净了，其他地方就不管了。南京河流的污染不仅仅是在南京地区，其他地区也有可能在进行污染。这种情况下，要解决这个问题，就不仅仅要解决南京市的问题，可能还有其他地区上游的问题。比如说上海的苏州河、上海的黄浦江等等，这些不仅仅是上海的污染，还有上游的污染。"
这位环保人士表示，中国政府的垃圾管理和清运工作作得不好，民众的环保意识也有待加强： "当然，一个是老百姓的意识不高，还有一个就是政府的监管、政府的清运垃圾的管理是不是已经跟上了？我刚才讲了，那个河流不仅仅是南京的河流，因为这个河流是从南京以外流过来的。上游地区是不是也监管到了？政府在这方面的工作是不是已经做得很细了？我们举个例子，在街边有没有垃圾桶？如果有垃圾桶的话可能会把垃圾扔到垃圾桶，比如吐了个痰到纸里面，可能顺手就扔到桶里面了。如果走了一、两个小时都没有垃圾桶，你该怎么办？所以，政府在垃圾管理上一定要跟上，包括垃圾的清运，垃圾的处理设施。另外，要加强对老百姓的宣传教育。"
环保专家高放博士表示，中国应当借鉴美国的垃圾清理系统和相关法规的实施： "实际上垃圾问题美国也有。比如说我的房子后面有条小河，雨一下大了，偶尔两年一次也是水一上岸以后，把垃圾，虽然不是很多，也是冲得满地都是。美国的垃圾量大概我想是中国的三到四倍，我说的是人均。但是，美国垃圾处理的整个系统比较好，没有大量的垃圾直接倾倒到河床、河道里。也就是说，它的法规制定得比较严格。中国这样的法规也有，但是执行起来不大有力，这也就造成了象秦淮河这样大水一泛滥，垃圾就漂泊上岸。"
高博士表示，垃圾的处理不是一件小事，国家领导人应当过问了，他本人也有意向中国介绍不产生二次污染的垃圾焚烧技术： "垃圾问题现在已经关系到国家形象和老百姓的生活质量问题了。温总理应该过问这个事情了，这不是一个小事情。上面这些领导前一段可能就忙十七大，忙一些大政方针的问题。现在这些问题我想应该解决了。我有一个同事，一个朋友，过去的四、五年我一直在帮他做。现在就是想在国内推动一个叫做第三代垃圾焚烧技术，这个技术主要的特点就是不产生二次污染，可以最大限度地减少垃圾的量。也就是说，固体垃圾焚烧掉以后，就有96%，97% 的体积会缩小。但是这个技术有一个问题就是造价和投资比较高。"
中国环保人士吴琦建议，秦淮河沿岸应培植一个五十米宽的植物带，以阻挡岸边垃圾、泥土流入河中，但当务之急是用铁丝网拦截岸上垃圾。
