今年是清华大学建校100周年的大庆。在百年大庆的时候，是否应该问一问，什么是清华大学的灵魂？
北京《中国周刊》主编朱学东认为，独立自由的探索精神应该是一所不朽大学的灵魂，它不应因社会变迁和政权更替而改变。笔者赞同这个观点并认为，马寅初，梁思成和黄万里是清华大学院独立自由探索精神的代表。
另一种观点认为：“爱国奉献、追求卓越”是清华大学的灵魂，更有人把它简化为“精忠报党”。百年大庆，官方推出了水利系的张光斗作为当今清华大学的代表，其生日也成为百年校庆的最主要内容。校庆期间，清华校友追思黄万里的集会，因遭受压力被迫取消。章立凡写道：“百年清华园，不再有梁启超、王国维、陈寅恪、赵元任，不再有梅贻琦，不再有黄万里，不再有“独立之精神，自由之思想”，只剩下标准件制造和“工程师治国”。特此致哀。”
黄万里和张光斗，两个早年从美国留学归来的学子，一个博士，一个双硕士；一个右派分子，一个优秀党员；一个永持批判态度，一个常写思想汇报；一个挺着胸脯说话，一个夹着尾巴做人；一个布衣教师，一个两院院士。虽然两人同在清华大学水利系同事几十年，却代表了两个截然不同的清华大学灵魂。
2011年4月15日在陆钦侃先生的遗体告别上有这么一副对联：
人云无法亦云三峡关乎民生子丑寅卯是非有赖我公砥中流
敢做未必敢当国事居然儿戏张钱邓李功罪无需他人付信史
张钱邓李，第一个张是张光斗。“敢做未必敢当”一语，可谓击中要害。张光斗被官方誉为是中国水利泰斗。中华人民共和国几代领导人都特别喜欢治水，都把张光斗作为其水利政策的顾问。表面上是对张光斗言听计从，实际上是政治家把他们想干的事，通过张光斗的嘴说出来，传播出去。张光斗所缺乏的正是独立自由的探索精神。张光斗一生参与或主持设计的有黄河三门峡大坝工程，密云水库大坝工程和长江三峡大坝工程等。但是在百年校庆的《清华大学隆重庆祝张光斗先生奉献祖国水利水电事业七十周年》消息报道中，只提密云水库工程，却不提黄河三门峡工程，也不提长江三峡大坝工程。黄河三门峡工程的失败是不争的事实，尽管张光斗说，当年他和钱正英都是反对黄河三门峡工程，但是现存资料不能证明这个说法。那么为什么不提长江三峡大坝工程？难道三峡工程也是张光斗的走麦城？
建设三峡工程的最主要目的是防洪
建设三峡工程的最主要目的是防洪，依靠的是水库的防洪库容。官方公布的三峡水库防洪库容是221亿立方，这是夸大的防洪库容，是技算错误的结果。这个错误张光斗早已知道。他写信告诉中央领导：“三峡大坝的防洪能力比我们对外宣称的要低，清华大学曾做过一份调查研究，政协副主席钱正英看过后曾以此质疑长江资源委员会，该委员会承认清华大学的这份报告没错。但是，我们只能以降低蓄洪量到一百三十五公尺来解决这个问题，即使这会影响长江江面的正常航行。”
最后，政治家拒绝张光斗降低水位的建议，张也不敢据理力争。张光斗的这种行为于国于民于清华大学有百害而无一利。
三峡工程可行性论证环境组的结论是，三峡工程对生态环境的影响是弊大于利。但是到审批时结论被改为利大于弊，对此张光斗一言不发。当世界最大的水电工程截流之后，张光斗又给中央领导写信，表示他对三峡库区水污染问题十分担忧，建议投资三千亿元处理水污染问题。三峡库区水污染问题的最根本原因是建坝之后流速变缓，河流自净能力减弱。三峡工程总造价两千亿元，处理工程带来的水污染问题投资三千亿元，弊大利小，一清二楚。张光斗的这种“爱国奉献、追求卓越”精神，于国于民于清华大学有百害而无一利。
黄万里则是在没有一分科研经费的条件下，完成对三峡工程工程的多项研究。他多次上书中央，明确指出，以中国的自然地理和（砾石泥沙运行的）自然规律，一个尊重科学民主的政府根本不许可建造三峡筑高坝这样的工程。他预警了蓄水后卵石淤塞重庆、四川水患、浩大的工程开销和必将酿成祸患的移民安置。就在他生命的最后一刻，在清华大学医院的普通病房中，他仍然关心的是长江防洪，指出要加固长江堤防。
目前中国流传一个说法，黄万里在黄河三门峡工程上的观点是正确的，但是在长江三峡工程上的观点却是错误的，理由是三峡水库淤积问题并不如黄万里预测的那么严重。
其实，三峡工程至今尚未找到解决砾卵石和泥沙淤积的办法，所谓的“排浑蓄清”措施已经被水库运行的实践证明是不可行的。采用“排浑蓄清”，三峡水库在枯水期不可能蓄水至海拔175米。目前采取的补救办法就是在三峡水库上游建造大量的水库大坝，阻拦进入三峡水库的砾卵石和泥沙。这不是解决了砾卵石和泥沙淤积问题，而是把问题向后推移，推给子孙后代。
自2003年三峡水库135米蓄水以来至2010年9月，金沙江和嘉陵江进入三峡水库的泥沙约为15.7亿吨，加上三峡库区入库泥沙约7.2亿吨（绝对不能忽略不计），共计23.2亿吨，出库泥沙约为4.1亿吨，水库淤积泥沙约19.1亿吨，水库排沙为17.7%。累积淤积泥沙量已经超过黄河三门峡水库！2010年重庆港因淤积已经出现碍航现象。
目前，重庆港现在已经开始下移到重庆寸滩，未来将下移到万州。当年黄万里先生预测的重庆港被淤，虽然由于上游建库拦截砾石泥沙而有所推迟，但是却是不可更改的发展事实。因此，关于张光斗的报道中，不提他主持长江三峡大坝工程初步设计，也算是有先见之明。
什么是清华大学的灵魂？这个问题关系到清华大学的未来发展。如果清华大学把目标定在2020年达到世界一流大学水平，并在2050年跻身世界一流大学前列，那么非提倡马寅初，梁思成和黄万里所代表的独立自由的探索精神不可；如果清华大学满足于为中国提供了最多的领导人和院士这样的成绩，那么大力宣传张光斗的“爱国奉献、追求卓越”，正是最容易的途径。
