明报消息，21世纪经济报道引述国家审计署不具名的官员指出，对去年的决算情审计发现，中央部门的预算管理存在四大问题：
其一，本级预算管理不规范。被审计的60个中央部门中，23个未按规定细化预算或预算编制不完整、6个部门没按规定及时足额批覆预算、12个部门擅自调整预算项目及金额。
其二，中央部门对属下单位疏于管理监督。在200多个这类单位中，隐瞒收入、私设帐外帐等问题金额高达37亿元，其中国家气象局及其直属18个单位就查出违规违纪金额2.29亿元。水利部原信息研究所以建设“东小楼改造附属工程”为名，编造虚假项目预算和施工合同，骗取国家预算135万元，变成职工补贴。
其叁，收支混淆不上缴。14个部门自立项目或超范围收费5.22亿元；15个部门应缴未缴中央预算收入3.31亿元；29个部门未按规定上缴财政专户资金18.53亿元；26个部门隐瞒、截留或擅支预算外资金2.68亿元，有的甚至设立帐外帐。
其四，决算编报不实。25个部门涉及少报收支和结馀、少计资产、少汇所属单位决算报表的金额共达41亿元。
部委撤并拨款移交混乱
另外，预算资金结存也有很大漏洞。国务院机构改革以来，一些部委撤并，但下拨的预算资金却未及时处理；高校改革，相当部分高校预算拨款仍在原主管部委手中。这些结存少则一两亿，多达百亿。按规定都要纳入财政部统一管理，但一些部门违规不报，甚至变成部门小金库，或对外投资，或变相成了职工福利，成为衍生腐败的条件。
另外，中央部门经过多轮改革，很多部委人数已大幅精简，但审计结果显示，多数部门公务用车的数量和质量却在不降反升。
今年组200人审计队
报道称，国家审计署日前已组成200人审计队伍，对中央各部委开展审计，其中资金结存将成为突破口。审计署官员称，到2006年，除少数涉及国家利益和秘密的内容，审计内容和报告一律公开。
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